More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0965 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 176 aa  347  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  56.61 
 
 		 229 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6582  ribosomal protein L17  60.23 
 
 		 196 aa  193  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  58.66 
 
 		 172 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  61.27 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  62.35 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  60.12 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  75.86 
 
 		 190 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  67.39 
 
 		 222 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  66.9 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  65.44 
 
 		 219 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0611  50S ribosomal protein L17  64.38 
 
 		 206 aa  183  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.595155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  74.36 
 
 		 176 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1218  50S ribosomal protein L17  57.39 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  64.93 
 
 		 268 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  73.28 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  71.67 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2625  ribosomal protein L17  63.25 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04280  LSU ribosomal protein L17P  63.76 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  62.57 
 
 		 197 aa  177  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  72.73 
 
 		 180 aa  177  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  56.42 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  56.42 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  56.42 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  66.41 
 
 		 202 aa  175  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  69.83 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  70.25 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6021  50S ribosomal protein L17  63.35 
 
 		 195 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79372  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0655  ribosomal protein L17  68.97 
 
 		 178 aa  167  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.929452  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3381  ribosomal protein L17  61.94 
 
 		 233 aa  165  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4969  50S ribosomal protein L17  71.07 
 
 		 199 aa  164  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.392078  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0614  ribosomal protein L17  55.31 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  57.34 
 
 		 144 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29450  LSU ribosomal protein L17P  57.86 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0149004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16890  LSU ribosomal protein L17P  51.41 
 
 		 242 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2939  50S ribosomal protein L17  61.43 
 
 		 196 aa  154  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  61.4 
 
 		 118 aa  148  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  62.07 
 
 		 183 aa  147  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2654  50S ribosomal protein L17  62.99 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 155 aa  141  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  48.62 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 127 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 178 aa  134  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  46.02 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  53.85 
 
 		 143 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1174  ribosomal protein L17  48.45 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 141 aa  131  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  45.76 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  51.61 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  53.7 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 140 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  59.6 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  41.9 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.39 
 
 		 124 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  54.7 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  53.21 
 
 		 140 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  45.28 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 137 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 140 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  49.57 
 
 		 140 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  56.88 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  41.18 
 
 		 151 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 117 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 208 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 138 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  52.14 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 142 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 142 aa  121  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  51.38 
 
 		 142 aa  121  6e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0687  50S ribosomal protein L17  56.9 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 140 aa  120  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 146 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  50.46 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  58.42 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 114 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01460  ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 247 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.186143  normal  0.514697 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  51.28 
 
 		 137 aa  118  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  51.35 
 
 		 112 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 140 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 135 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 138 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 138 aa  117  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  46.15 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  48.31 
 
 		 126 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>