242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0672 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  100 
 
 		 164 aa  327  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  62.2 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  61.54 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  59.23 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.02 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  72.83 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  71.43 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  51.2 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  53.19 
 
 		 145 aa  117  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  57.25 
 
 		 143 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  48.91 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  54.76 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.97 
 
 		 143 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  59.78 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.2 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  54.84 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  54.76 
 
 		 147 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  58.04 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  56.69 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  57.36 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  48.33 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  56.15 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.77 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  49.61 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.06 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.4 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.56 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  55.56 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.43 
 
 		 138 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.11 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  57.97 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  44.44 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.4 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1587  protein chain release factor B-like protein  37.88 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.48 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  40.77 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  39.85 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.58 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0026  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.53 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.83 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  41.27 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.8 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.69 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  37.01 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  42.4 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.53 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3254  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.96 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  40.32 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4768  Class I peptide chain release factor  44.44 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.58 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0875  class I peptide chain release factor  39.06 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.174449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  40 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357715 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.31 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0202  hypothetical protein  43.18 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0245  class I peptide chain release factor  38.1 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.84131  normal  0.608303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  40.31 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.31 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0128  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.69 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.31 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.09 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.62 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  41.98 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2493  class I peptide chain release factor  39.23 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201964  normal  0.890427 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4258  class I peptide chain release factor  42.86 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.4 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1981  Class I peptide chain release factor  33.85 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000274722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6283  class I peptide chain release factor  33.6 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.426377 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29491  hypothetical protein  80.49 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  39.1 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4087  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  33.86 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3284  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.28 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.72 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  42.54 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  42.86 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  42.86 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.521154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2742  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.8 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.12 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.66 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.06 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4298  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.62 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.31 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3519  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.31 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0512  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  32.31 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.13 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.21 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1858  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.92 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102554  normal  0.117146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2836  class I peptide chain release factor  37.29 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  38.58 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3557  hypothetical protein  41.18 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3853  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.3 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2216  Class I peptide chain release factor  34.35 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2298  class I peptide chain release factor  38.46 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3347  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.3 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3971  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.41 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3797  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.3 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0177584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  31.3 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00322425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>