187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0417 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  100 
 
 
592 aa  1168    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  51.45 
 
 
672 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.35 
 
 
416 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  55.49 
 
 
1407 aa  363  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  51.53 
 
 
381 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  53.83 
 
 
682 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  51.36 
 
 
413 aa  343  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.07 
 
 
412 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  44.09 
 
 
788 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.01 
 
 
434 aa  303  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.55 
 
 
423 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  47.37 
 
 
429 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  41.96 
 
 
710 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.48 
 
 
403 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.23 
 
 
403 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.49 
 
 
405 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.25 
 
 
403 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.25 
 
 
403 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  44.28 
 
 
383 aa  220  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  40.94 
 
 
406 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  40.94 
 
 
406 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  40.94 
 
 
406 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  40.94 
 
 
406 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  40.94 
 
 
406 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  40.94 
 
 
406 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  40.94 
 
 
406 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  37.8 
 
 
406 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  37.22 
 
 
404 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  35.51 
 
 
410 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6403  Ig family protein  61.38 
 
 
884 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  29.65 
 
 
797 aa  148  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  35.41 
 
 
511 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7496  glycoside hydrolase family 8  69.79 
 
 
691 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  31.09 
 
 
446 aa  118  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  64.71 
 
 
1243 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.71 
 
 
1271 aa  114  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  55.56 
 
 
601 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.31 
 
 
596 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  61.76 
 
 
1147 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  70.41 
 
 
1131 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  31.11 
 
 
534 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  29.44 
 
 
672 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.07 
 
 
467 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  33.33 
 
 
519 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  31.66 
 
 
553 aa  98.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  29.83 
 
 
524 aa  98.2  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
1072 aa  97.8  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  33.62 
 
 
519 aa  97.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  32.02 
 
 
519 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  30 
 
 
529 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  29.97 
 
 
529 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  58.82 
 
 
597 aa  94  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  29.69 
 
 
529 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  29.69 
 
 
577 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  30.68 
 
 
622 aa  93.2  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  33.16 
 
 
777 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  26.26 
 
 
540 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.72 
 
 
529 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.72 
 
 
529 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.28 
 
 
538 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  29.41 
 
 
529 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  29.41 
 
 
529 aa  91.3  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  31.54 
 
 
1077 aa  90.9  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  27.23 
 
 
976 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  41.04 
 
 
788 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  30.58 
 
 
529 aa  90.5  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.3 
 
 
529 aa  90.5  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  26.4 
 
 
540 aa  90.5  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  30 
 
 
1308 aa  90.1  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0444  Ricin B lectin  52.94 
 
 
586 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.828213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.48 
 
 
464 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.2 
 
 
534 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  67.39 
 
 
580 aa  87.4  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  30.13 
 
 
658 aa  87  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1899  protease-like protein  26.6 
 
 
479 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  28.76 
 
 
531 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  31.94 
 
 
611 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  62.5 
 
 
1077 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  30.79 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  29.14 
 
 
527 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  29.74 
 
 
577 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  39.44 
 
 
610 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5797  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  56.44 
 
 
727 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  29.41 
 
 
507 aa  82  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  38.89 
 
 
610 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  38.89 
 
 
610 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  38.89 
 
 
610 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  30.22 
 
 
562 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  29.4 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  29.4 
 
 
562 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  29.4 
 
 
562 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4782  peptidase M4 thermolysin  53.06 
 
 
802 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0253013 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  29.84 
 
 
1199 aa  79  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  37.36 
 
 
579 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  59.77 
 
 
824 aa  77  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.55 
 
 
674 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1270  Ig family protein  43.12 
 
 
753 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902068  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.75 
 
 
577 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.75 
 
 
577 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  35.75 
 
 
577 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>