126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3699 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  100 
 
 
514 aa  1076    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  59.18 
 
 
520 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  53.94 
 
 
524 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  53.54 
 
 
524 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  52.36 
 
 
517 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  53.68 
 
 
526 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  52.25 
 
 
517 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  52.35 
 
 
543 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  52.35 
 
 
543 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  51.59 
 
 
537 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  51.79 
 
 
543 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  52.02 
 
 
525 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  51.47 
 
 
522 aa  560  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  51.79 
 
 
543 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  51.61 
 
 
528 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  50.39 
 
 
508 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  49.32 
 
 
514 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  48.44 
 
 
520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  48.93 
 
 
505 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  48.63 
 
 
527 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  46.47 
 
 
513 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  44.87 
 
 
531 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  42.3 
 
 
524 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  42.28 
 
 
518 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  42.86 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  42.86 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  42.86 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  41.6 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  39.81 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  41.13 
 
 
508 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  40.23 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  40.82 
 
 
507 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  40.08 
 
 
507 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  39.96 
 
 
508 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  39.22 
 
 
522 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  40.2 
 
 
507 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  39.84 
 
 
508 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  40.26 
 
 
507 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  40.38 
 
 
511 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  40.47 
 
 
510 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  39.27 
 
 
515 aa  363  6e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  36.83 
 
 
537 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  33.75 
 
 
498 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1939  tryptophan halogenase  34.69 
 
 
517 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.55 
 
 
505 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.55 
 
 
508 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  34.79 
 
 
499 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.65 
 
 
492 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  33.9 
 
 
499 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
508 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.06 
 
 
502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  32.29 
 
 
504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  30.65 
 
 
507 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  34.03 
 
 
499 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  32.58 
 
 
501 aa  243  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  32.58 
 
 
501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  34.39 
 
 
502 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  30.79 
 
 
529 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  30.58 
 
 
529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  35.86 
 
 
515 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  35.15 
 
 
497 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  32.77 
 
 
509 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  31.52 
 
 
505 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  31.24 
 
 
497 aa  232  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  33.61 
 
 
495 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  31.02 
 
 
500 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  33.96 
 
 
501 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  32.85 
 
 
501 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  32.63 
 
 
500 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  31.19 
 
 
511 aa  226  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  31.75 
 
 
512 aa  226  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  29.18 
 
 
538 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  31.69 
 
 
503 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0803  tryptophan halogenase  34.62 
 
 
506 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  31.14 
 
 
503 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  31.5 
 
 
503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  31.66 
 
 
504 aa  223  6e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  31.5 
 
 
503 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  31.15 
 
 
502 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0740  tryptophan halogenase  32.5 
 
 
505 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.726405  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  30.04 
 
 
523 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  32.22 
 
 
506 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  30.78 
 
 
496 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1290  tryptophan halogenase  32.87 
 
 
503 aa  220  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  31.11 
 
 
509 aa  220  6e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  30.91 
 
 
501 aa  219  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  30.59 
 
 
504 aa  219  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  30.23 
 
 
506 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  29.65 
 
 
510 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  30.69 
 
 
505 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  29.29 
 
 
538 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  32.37 
 
 
502 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  34.17 
 
 
505 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0182  tryptophan halogenase  32.2 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.736989  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  29.29 
 
 
538 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  29.26 
 
 
538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2807  tryptophan halogenase, putative  33.02 
 
 
503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000313891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1104  hypothetical protein  30.93 
 
 
740 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.181023  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  29.21 
 
 
538 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>