More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3538 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  46.35 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  44.04 
 
 		 260 aa  225  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  43.37 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  43.32 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  43.12 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  41.52 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  41.76 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  42.45 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  41.11 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  39.78 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  39.56 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  39.56 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  39.56 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  39.56 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  39.13 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  39.56 
 
 		 264 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  39.19 
 
 		 251 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  38.77 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  38.77 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  38.77 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  39.71 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  39.71 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  38.41 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  38.41 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  38.41 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  38.41 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  38.41 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  39.47 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  39.1 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  38.38 
 
 		 255 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  43.84 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  38.41 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  40.22 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  38.41 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  38.41 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  38.04 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  38.66 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  37.55 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  37.55 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  36.13 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  36.13 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  37.96 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  38.06 
 
 		 252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  39.82 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  34.8 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  33.82 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.16 
 
 		 903 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  38.76 
 
 		 944 aa  142  6e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  31.3 
 
 		 1022 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  31.76 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 988 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 956 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 861 aa  136  4e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 891 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  33.64 
 
 		 903 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  31.98 
 
 		 893 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 912 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 978 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 979 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 957 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  30.43 
 
 		 892 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  30.29 
 
 		 876 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  30.6 
 
 		 976 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 939 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  32.87 
 
 		 943 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  31.02 
 
 		 892 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  30.13 
 
 		 911 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  31.02 
 
 		 892 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  35.55 
 
 		 941 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  31.8 
 
 		 902 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 968 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  32.16 
 
 		 1060 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  30.6 
 
 		 992 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 902 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  33.17 
 
 		 888 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  32.52 
 
 		 892 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  33.19 
 
 		 931 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  30.88 
 
 		 940 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  30.9 
 
 		 1043 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  33.62 
 
 		 928 aa  119  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  33.21 
 
 		 924 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  31.39 
 
 		 956 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  33.18 
 
 		 951 aa  119  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  31.1 
 
 		 1016 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 1047 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  30.71 
 
 		 999 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  32.73 
 
 		 877 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  32.73 
 
 		 877 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  32.1 
 
 		 866 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 1047 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  30.48 
 
 		 883 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  32.03 
 
 		 928 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 1047 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 930 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>