More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0839 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0845  aminotransferase, class V  96.84 
 
 		 380 aa  759    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00507503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0839  aminotransferase, class V  100 
 
 		 380 aa  780    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.943478  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0265  aminotransferase, class V  50.28 
 
 		 373 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000264694  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0835  alanine--glyoxylate transaminase  38.25 
 
 		 384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  39.72 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1870  Serine--glyoxylate transaminase  37.16 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.856595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1612  Serine--glyoxylate transaminase  38.19 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0855  aminotransferase class V  38.01 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1789  aminotransferase class V  39.25 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.530358  normal  0.630477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0190  alanine--glyoxylate transaminase  35.95 
 
 		 384 aa  219  7.999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0814206  normal  0.663999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.77 
 
 		 382 aa  216  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4145  Serine--glyoxylate transaminase  32.35 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  33.69 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.42 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.15 
 
 		 382 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.96 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.06 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  32.51 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  32.51 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  34.88 
 
 		 383 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  32.32 
 
 		 363 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.79 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.97 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.05 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  31.52 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.52 
 
 		 362 aa  190  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  31.25 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.6 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  32.57 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  32.97 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  31.28 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  28.77 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  30.11 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  29.84 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  29.84 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  29.4 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  28.65 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  31.3 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.45 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  30.62 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  32.31 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  30.64 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  29.95 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  30.85 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  30.03 
 
 		 385 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  29.59 
 
 		 373 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2203  Serine--pyruvate transaminase  32.69 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  28.42 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.67 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  28.93 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  28.53 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  29.52 
 
 		 391 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  30.3 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  28.85 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  28.93 
 
 		 373 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  28.61 
 
 		 380 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  28.65 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  29.84 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  27.9 
 
 		 375 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  28.34 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  28.65 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  27.57 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  28.37 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  30.58 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  28.61 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  29.2 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  28.3 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  29.26 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  28.57 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  28.65 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  27.67 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  28.65 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  29.67 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2010  aminotransferase, class V  31.35 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  29 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  31.51 
 
 		 377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  27.52 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  28.53 
 
 		 401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  27.91 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  28.38 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  28.61 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  28.49 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.44 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  29.67 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  28.02 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  28.77 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  28.99 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.23 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  29.8 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  28.22 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  27.49 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  30.12 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  28.32 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  28.07 
 
 		 380 aa  160  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  27.84 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  29.14 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  30.65 
 
 		 375 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  27.84 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>