211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0044 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  100 
 
 		 297 aa  578  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  99.66 
 
 		 297 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3567  hypothetical protein  39.79 
 
 		 325 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.705614  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1632  hypothetical protein  39.41 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.426451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1762  hypothetical protein  39.41 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  38.13 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1610  permease  39.41 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1812  hypothetical protein  39.41 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1777  hypothetical protein  39.08 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.531787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  38.18 
 
 		 524 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1518  permease  37.5 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  39.59 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2648  permease  36.43 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0336  permease  34.71 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1540  permease  36.03 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000982093  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  35.21 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  38.69 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  37.54 
 
 		 524 aa  185  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2120  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1904  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000637927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1867  permease  34.68 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000789875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1857  permease  34.68 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000013234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2051  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2152  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0383281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1901  permease  34.68 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00015094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2041  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0774693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2084  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3268  hypothetical protein  34.68 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  31.83 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  31.93 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1694  permease  32.23 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000186998  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  30.63 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  30.63 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  30.77 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  30.2 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  31.56 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  28.99 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1140  permease  30.15 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.3687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0187  permease-like protein  29.45 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1859  permease  29.76 
 
 		 342 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2656  permease  29.69 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000475427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29321  permease  28.47 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1875  hypothetical protein  28.97 
 
 		 357 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2851  permease  30.71 
 
 		 352 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5330  permease  27.96 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1259  permease  27.27 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2796  permease  29.93 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.250331  normal  0.1662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3807  permease  39.84 
 
 		 362 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1359  permease  27.87 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4086  permease  26.17 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2194  permease  32.52 
 
 		 365 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0263  permease  24.75 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1600  permease  26.94 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0261  permease  24.41 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  25.57 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  24.67 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  21.69 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  20.36 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  28.25 
 
 		 350 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.91 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  24.34 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  25.55 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  23.05 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  24.82 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  24.54 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  24 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  21.85 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  20.58 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  26.55 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  28.57 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  23.86 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  23.86 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  22.18 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  23.86 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  21.84 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  24.71 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  23.86 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  23.68 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  23.86 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  26.49 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  19.87 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  23.3 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  22.73 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  24.07 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  22.22 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  24.05 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  25.93 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  24.21 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  25.27 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  21.31 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  19.45 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  23.03 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  21.78 
 
 		 358 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  24.01 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  24.01 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0289  permease  21.59 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0173  hypothetical protein  21.59 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  23.91 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  24.56 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  27.81 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>