275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2177 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 
391 aa  776    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  97.44 
 
 
391 aa  760    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  52.15 
 
 
398 aa  182  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  40.82 
 
 
280 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  40.91 
 
 
272 aa  99.8  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  31.74 
 
 
373 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.5 
 
 
1305 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  32.12 
 
 
571 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0103  transglutaminase domain protein  32.79 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.34 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  25.69 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  34.13 
 
 
485 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  30.58 
 
 
634 aa  63.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0009  transglutaminase domain-containing protein  33.64 
 
 
467 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.906543  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  26.11 
 
 
266 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  27.59 
 
 
484 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1325  transglutaminase domain protein  25.68 
 
 
680 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00529222  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  29.66 
 
 
478 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2471  transglutaminase domain-containing protein  29.87 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  35.83 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0466  transglutaminase family protein  32.29 
 
 
705 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  27.97 
 
 
478 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  30.69 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  29.59 
 
 
274 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  31.19 
 
 
376 aa  57  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0484  S-layer domain-containing protein  29.55 
 
 
586 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000124996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  38.89 
 
 
274 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  28.95 
 
 
492 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  35 
 
 
336 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  26.56 
 
 
485 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1852  protease  35.64 
 
 
386 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000203248  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1995  protease  35.64 
 
 
386 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000762612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1489  transglutaminase domain-containing protein  23.71 
 
 
662 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00458411  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  33.08 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  24.6 
 
 
288 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1807  murein endopeptidase  34.65 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4285  S-layer domain protein  28.57 
 
 
577 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00013823  normal  0.102971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2109  transglutaminase domain-containing protein  24.88 
 
 
709 aa  55.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  29.9 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1019  putative S-layer protein  28.57 
 
 
577 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0271963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2289  transglutaminase domain protein  36.99 
 
 
707 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0224849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  31.85 
 
 
730 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  25.49 
 
 
631 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1776  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
715 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1854  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
715 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2244  transglutaminase domain-containing protein  34.09 
 
 
715 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.572767  normal  0.393914 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0047  transglutaminase domain protein  29.32 
 
 
681 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10552  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1738  transglutaminase-like cysteine protease  33.8 
 
 
266 aa  53.9  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1877  transglutaminase-like  36.99 
 
 
667 aa  53.9  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2092  putative protease  32.11 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  32.22 
 
 
330 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  31.91 
 
 
279 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1839  transglutaminase-like protein  26.67 
 
 
653 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.544604  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02467  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
696 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2150  transglutaminase family protein  32.95 
 
 
732 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0884  S-layer protein  26.47 
 
 
578 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000197101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  30.16 
 
 
515 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0998  transglutaminase domain-containing protein  24.86 
 
 
762 aa  53.5  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.2813 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0900  S-layer protein  28.57 
 
 
578 aa  53.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000625317  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  25.58 
 
 
216 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1509  transglutaminase domain-containing protein  32.67 
 
 
386 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000210837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0916  S-layer protein  28.57 
 
 
577 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0018351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1823  murein endopeptidase  33.66 
 
 
386 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.57805e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2096  transglutaminase domain-containing protein  36.99 
 
 
734 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1997  putative protease  32.11 
 
 
386 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000694194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0981  s-layer protein  28.57 
 
 
577 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000154114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1056  putative S-layer protein  27.06 
 
 
576 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.48899e-34 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2028  putative protease  33.66 
 
 
386 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2049  transglutaminase domain-containing protein  36.99 
 
 
734 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3332  putative protease  32.11 
 
 
386 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000192317  unclonable  3.65908e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  26.55 
 
 
515 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1072  S-layer protein, putative  26.47 
 
 
578 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.043499  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1674  transglutaminase-like superfamily protein  39.44 
 
 
767 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1858  transglutaminase domain-containing protein  32.71 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000428903  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1144  S-layer protein  26.47 
 
 
578 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000385936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  28 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2418  transglutaminase domain-containing protein  22.95 
 
 
689 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2073  protease, putative  33.66 
 
 
386 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000121211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5565  transglutaminase-like  38.36 
 
 
676 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633958  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2448  transglutaminase domain-containing protein  36.49 
 
 
661 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401326  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2277  transglutaminase domain-containing protein  35.62 
 
 
739 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2128  transglutaminase domain-containing protein  38.36 
 
 
680 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0938  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 
438 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.522596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0881  S-layer domain-containing protein  27.65 
 
 
578 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000484445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  31.15 
 
 
337 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1137  transglutaminase domain-containing protein  26.99 
 
 
507 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 
649 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  38.36 
 
 
943 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4199  transglutaminase domain protein  29.37 
 
 
515 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.148466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1899  transglutaminase family protein  26.87 
 
 
689 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.642436  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4563  hypothetical protein  35.62 
 
 
739 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5097  hypothetical protein  36.71 
 
 
297 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  35.71 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4075  transglutaminase domain-containing protein  32.14 
 
 
287 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.399957 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  43.55 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2625  transglutaminase domain-containing protein  34.25 
 
 
667 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.253988  normal  0.029419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0916  transglutaminase domain-containing protein  31.03 
 
 
438 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1704  transglutaminase domain protein  29.66 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0326146  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  26.96 
 
 
261 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1885  transglutaminase domain-containing protein  35.37 
 
 
656 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307822  normal  0.724755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>