More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02180 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM02180  conserved hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1181    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.799124  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09138  acetamidase (Eurofung)  35.47 
 
 
585 aa  273  9e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166655  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88820  Acetamidase  35.57 
 
 
548 aa  270  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02662  conserved hypothetical protein  32.62 
 
 
536 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  33.21 
 
 
543 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01840  general amidase, putative  30.95 
 
 
551 aa  243  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03957  General amidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X144]  32.38 
 
 
561 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696881  normal  0.0809075 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02829  General amidase-C [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C7]  27.72 
 
 
538 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.308927  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  28.04 
 
 
556 aa  192  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02879  General amidase-BPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C8]  30.26 
 
 
543 aa  182  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15418 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10210  acetamidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05220)  30.24 
 
 
548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86089  amidase activity  29.83 
 
 
556 aa  181  4.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00303647  normal  0.387343 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08777  Acetamidase (EC 3.5.1.4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08158]  29.42 
 
 
548 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.440236 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47832  Acetamidase  27.57 
 
 
541 aa  176  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48268  amidase  28.67 
 
 
572 aa  173  6.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12740  predicted protein  28.75 
 
 
459 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.60383  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04195  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
598 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142073  normal  0.334259 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00783  general amidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14530)  28.09 
 
 
533 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  33.24 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  28.73 
 
 
499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  33.53 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  27.78 
 
 
466 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4139  amidase  28.94 
 
 
483 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  30.71 
 
 
500 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  29.87 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  26.97 
 
 
505 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  32.13 
 
 
447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  36.23 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  29.73 
 
 
490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2578  amidase  28.24 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  22.63 
 
 
485 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7092  amidase  26.02 
 
 
485 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.73 
 
 
475 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.75 
 
 
464 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  28.23 
 
 
472 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  31.56 
 
 
470 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  28.38 
 
 
485 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.29 
 
 
472 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3880  Amidase  38.04 
 
 
508 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777875  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  29.29 
 
 
456 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  29.59 
 
 
466 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  32.05 
 
 
455 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  32.63 
 
 
477 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  32.74 
 
 
446 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  30.6 
 
 
472 aa  95.1  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  35.5 
 
 
507 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  36.46 
 
 
494 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.99 
 
 
480 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  28.76 
 
 
462 aa  94  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.78 
 
 
475 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7130  amidase  27.41 
 
 
489 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  34.6 
 
 
507 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  36.69 
 
 
459 aa  93.2  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  29.93 
 
 
466 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  35.94 
 
 
475 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  25.19 
 
 
485 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  32.1 
 
 
473 aa  92.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1123  Amidase  34.85 
 
 
472 aa  92.8  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  23.86 
 
 
485 aa  91.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.68 
 
 
494 aa  91.3  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0653  amidase  35.32 
 
 
466 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  35.91 
 
 
496 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.97 
 
 
475 aa  91.3  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  28.93 
 
 
474 aa  90.9  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  35.05 
 
 
494 aa  90.9  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3235  amidase  33.95 
 
 
488 aa  90.9  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0114439  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  35.05 
 
 
494 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  35.05 
 
 
494 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  35.05 
 
 
494 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  28.61 
 
 
485 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.18 
 
 
483 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  26.71 
 
 
499 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  25.05 
 
 
480 aa  90.1  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.48 
 
 
473 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  32.59 
 
 
462 aa  89.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  33.67 
 
 
494 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0495  amidase  34.25 
 
 
505 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  35.87 
 
 
494 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3620  amidase  25.96 
 
 
473 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  28.54 
 
 
549 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.72 
 
 
484 aa  87.8  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.89 
 
 
489 aa  88.2  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  29.69 
 
 
458 aa  87.8  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  25.34 
 
 
463 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  30.14 
 
 
466 aa  87.4  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5792  hypothetical protein  32.81 
 
 
456 aa  87.4  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0135813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  33.18 
 
 
467 aa  87.4  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  29.53 
 
 
464 aa  87.4  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  36.93 
 
 
469 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  23.02 
 
 
483 aa  87  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.02 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3120  amidase  29.97 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  33.33 
 
 
508 aa  86.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0220  amidohydrolase, AtzE family  30.64 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  28.75 
 
 
463 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5248  Amidase  35.37 
 
 
457 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000283595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  33.2 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  32.05 
 
 
472 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  33.33 
 
 
484 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  34.45 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>