More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1123 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1123  Amidase  100 
 
 
472 aa  921    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  30.04 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  32.84 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.88 
 
 
472 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.17 
 
 
481 aa  159  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  35.1 
 
 
469 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  35.5 
 
 
447 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1333  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.17 
 
 
479 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.23 
 
 
479 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  31.01 
 
 
482 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  27.84 
 
 
446 aa  143  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  29.55 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  30 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  31.35 
 
 
499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  30.97 
 
 
458 aa  139  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  32.61 
 
 
459 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.25 
 
 
477 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  29.89 
 
 
477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  27.1 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1302  amidase  32.99 
 
 
477 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  33.61 
 
 
467 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.6 
 
 
491 aa  133  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3059  amidase  31.34 
 
 
473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.477089  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  29.39 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  30.07 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  34.02 
 
 
467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2878  indole acetimide hydrolase  33.4 
 
 
467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  34.1 
 
 
454 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  34.02 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  34.02 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  34.02 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  29.79 
 
 
477 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0495  amidase  32.06 
 
 
505 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3768  amidase  32.99 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30926  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1917  hypothetical protein  27.21 
 
 
494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  29.12 
 
 
494 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.05 
 
 
475 aa  126  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  32.3 
 
 
467 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  32.85 
 
 
473 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  40 
 
 
484 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  41.71 
 
 
470 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  39.52 
 
 
461 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  28.45 
 
 
475 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7797  amidase  31.59 
 
 
447 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.986021  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1335  Amidase  32.82 
 
 
454 aa  123  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.844408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  31.35 
 
 
484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5981  amidase  32.51 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0693963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  30.04 
 
 
496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  29.45 
 
 
494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  29.64 
 
 
485 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  28.51 
 
 
494 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  29.66 
 
 
494 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  29.02 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.33 
 
 
480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2653  Amidase  25.88 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  30.63 
 
 
505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  29.18 
 
 
480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  30.74 
 
 
469 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  30.1 
 
 
495 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  29.24 
 
 
500 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  30.37 
 
 
479 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  32.52 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1493  amidase  29.28 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.807355  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3835  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.92 
 
 
489 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.677458 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  39.15 
 
 
483 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  32.72 
 
 
477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  27.27 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  27.19 
 
 
543 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  29.5 
 
 
462 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02829  General amidase-C [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C7]  33.14 
 
 
538 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.308927  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  31.08 
 
 
490 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  41.05 
 
 
510 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  27.72 
 
 
485 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.6 
 
 
487 aa  117  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  30.06 
 
 
463 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  42.17 
 
 
461 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4592  amidase  44.69 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317108  normal  0.0439274 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  31.66 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3977  amidase  31.63 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  32.53 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  30.48 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  27.89 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  30.4 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3159  amidase  32.75 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1619  amidase  31.58 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.56 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.22 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  29.31 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4139  amidase  29.79 
 
 
483 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  29.81 
 
 
507 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4656  amidase  32.49 
 
 
482 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292034  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  27.54 
 
 
470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  37.04 
 
 
474 aa  114  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1011  indole acetimide hydrolase  32.13 
 
 
484 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0836853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  31.51 
 
 
466 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3028  amidase  34.58 
 
 
467 aa  113  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.18 
 
 
475 aa  113  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.32 
 
 
463 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  30.5 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1980  amidase  36 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0409762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>