More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE05150 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1233    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  44.16 
 
 
545 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  38.28 
 
 
567 aa  287  4e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  38.98 
 
 
474 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00220  RNA helicase, putative  37.92 
 
 
710 aa  272  1e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.063496  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43135  predicted protein  39.05 
 
 
587 aa  261  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24935  helicase_1  37 
 
 
455 aa  251  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00894  DEAD box RNA helicase HelA, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15620)  33.33 
 
 
641 aa  240  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.859671  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  33.63 
 
 
567 aa  229  2e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  37.62 
 
 
485 aa  228  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 
607 aa  225  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  35.16 
 
 
609 aa  225  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 
405 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  38.52 
 
 
469 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 
497 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  38.58 
 
 
481 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  39.08 
 
 
627 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 
474 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.56 
 
 
456 aa  206  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.07 
 
 
423 aa  205  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  38.22 
 
 
491 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0448  DEAD/DEAH box helicase-like  35.42 
 
 
458 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0687758  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  35.89 
 
 
481 aa  203  6e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  36.22 
 
 
394 aa  203  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.5 
 
 
480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  37.77 
 
 
482 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  37.43 
 
 
477 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  36.29 
 
 
552 aa  201  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.98 
 
 
580 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  37.23 
 
 
484 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.6 
 
 
567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.96 
 
 
559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.12 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.39 
 
 
439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.44 
 
 
441 aa  198  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.88 
 
 
418 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.684859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.85 
 
 
506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1778  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.07 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.73 
 
 
583 aa  197  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.95 
 
 
511 aa  197  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  38.16 
 
 
472 aa  197  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  35.11 
 
 
533 aa  196  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.28 
 
 
590 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  35.58 
 
 
527 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.28 
 
 
502 aa  196  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  32.92 
 
 
812 aa  196  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  36.81 
 
 
476 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54281  Mitochondrial RNA helicase of the DEAD box family  34.97 
 
 
468 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0633704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
454 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  35.45 
 
 
492 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.27 
 
 
545 aa  196  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 
520 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  35.97 
 
 
520 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  35.12 
 
 
507 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  32.53 
 
 
765 aa  195  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
549 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 
520 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
578 aa  195  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.1 
 
 
482 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.9 
 
 
506 aa  194  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  34.74 
 
 
397 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1070  ATP-dependent RNA helicase RhlB  34.74 
 
 
483 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  35.96 
 
 
529 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.02 
 
 
598 aa  195  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
439 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2938  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
427 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71109  normal  0.0696862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  35.96 
 
 
507 aa  194  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
460 aa  194  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.49 
 
 
535 aa  194  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.97 
 
 
571 aa  194  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2361  DEAD/DEAH box helicase-like  34.17 
 
 
422 aa  194  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122997  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  36.26 
 
 
405 aa  194  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0501  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.96 
 
 
451 aa  193  6e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
549 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2495  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
427 aa  193  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.12 
 
 
507 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.46 
 
 
473 aa  193  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  35.36 
 
 
495 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
427 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.29 
 
 
427 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404894  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  35.97 
 
 
559 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  35.97 
 
 
482 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.97 
 
 
482 aa  193  8e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.97 
 
 
482 aa  193  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  35.97 
 
 
482 aa  193  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  35.97 
 
 
481 aa  193  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  35.97 
 
 
482 aa  193  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.04 
 
 
522 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.15 
 
 
571 aa  193  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  34.09 
 
 
672 aa  192  1e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  35.46 
 
 
527 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.2 
 
 
423 aa  193  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0620  ATP-dependent RNA helicase RhlB  36.19 
 
 
392 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2156  ATP-dependent RNA helicase RhlB  37.13 
 
 
544 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.34 
 
 
461 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.29 
 
 
624 aa  192  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
509 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  35.42 
 
 
495 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0819  DEAD/DEAH box helicase  35.34 
 
 
461 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82655  ATP-dependent RNA helicase CA3 of the DEAD/DEAH box family  35.13 
 
 
526 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>