More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01840 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE01840  general amidase, putative  100 
 
 
551 aa  1136    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88820  Acetamidase  42.86 
 
 
548 aa  466  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02662  conserved hypothetical protein  44.57 
 
 
536 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03957  General amidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X144]  39.29 
 
 
561 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696881  normal  0.0809075 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  38.19 
 
 
543 aa  360  3e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  38.31 
 
 
556 aa  359  8e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08777  Acetamidase (EC 3.5.1.4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08158]  38.22 
 
 
548 aa  358  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.440236 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10210  acetamidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05220)  37.75 
 
 
548 aa  341  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02829  General amidase-C [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C7]  33.69 
 
 
538 aa  311  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.308927  normal  0.124376 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04195  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 
598 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142073  normal  0.334259 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47832  Acetamidase  36.07 
 
 
541 aa  298  1e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02879  General amidase-BPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C8]  34.77 
 
 
543 aa  281  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15418 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48268  amidase  33.39 
 
 
572 aa  271  2.9999999999999997e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02180  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 
573 aa  257  4e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.799124  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86089  amidase activity  33.4 
 
 
556 aa  247  3e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00303647  normal  0.387343 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00783  general amidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14530)  31.29 
 
 
533 aa  236  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09138  acetamidase (Eurofung)  29.53 
 
 
585 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166655  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08303  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 
543 aa  219  8.999999999999998e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000993365 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12740  predicted protein  26.75 
 
 
459 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.60383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  29.5 
 
 
469 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  29.06 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  32.13 
 
 
447 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  31.42 
 
 
467 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  30.9 
 
 
466 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  29.49 
 
 
477 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  32.47 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  31.27 
 
 
466 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  31.42 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  31.27 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  32.11 
 
 
475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  34.8 
 
 
472 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  26.92 
 
 
493 aa  113  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  32.01 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1407  amidase  32.16 
 
 
473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  34.62 
 
 
477 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  32.51 
 
 
494 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  30.19 
 
 
472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  41.92 
 
 
459 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.2 
 
 
494 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1577  amidase  30.53 
 
 
478 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  30.06 
 
 
469 aa  110  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  33.75 
 
 
494 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  33.89 
 
 
494 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.6 
 
 
485 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  31.4 
 
 
474 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.33 
 
 
494 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  29.75 
 
 
469 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  28.8 
 
 
472 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.33 
 
 
494 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.33 
 
 
494 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  27.09 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  25.43 
 
 
505 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  25.24 
 
 
549 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  31.62 
 
 
473 aa  106  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  30.57 
 
 
464 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  34.71 
 
 
467 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3796  putative amidase  32.65 
 
 
500 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1293  amidase  31.02 
 
 
461 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.66959  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0894  amidase  30.06 
 
 
464 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1318  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.85 
 
 
502 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497097  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  30 
 
 
480 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  26.77 
 
 
466 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  30.59 
 
 
490 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.15 
 
 
483 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.28 
 
 
485 aa  103  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  26.41 
 
 
471 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  29.39 
 
 
465 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  35.19 
 
 
485 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5261  amidase  34.93 
 
 
473 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503893  normal  0.344204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1115  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.36 
 
 
485 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00160205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  30.38 
 
 
473 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.73 
 
 
475 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6034  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.75 
 
 
506 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  34.06 
 
 
461 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.08 
 
 
495 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.92 
 
 
485 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  32.86 
 
 
466 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  32.49 
 
 
490 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.56 
 
 
458 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.64 
 
 
485 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  28.78 
 
 
471 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  29.24 
 
 
455 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  28.82 
 
 
524 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.74 
 
 
496 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3768  amidase  34.62 
 
 
498 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30926  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7092  amidase  30.88 
 
 
485 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  31.31 
 
 
464 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.8 
 
 
489 aa  99.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.73 
 
 
483 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  32.16 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0495  amidase  31.56 
 
 
505 aa  99.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  33.61 
 
 
495 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.3 
 
 
474 aa  99  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  27.73 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3296  amidase  29.73 
 
 
471 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297102  normal  0.0238145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  31.33 
 
 
475 aa  99  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  34.15 
 
 
491 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.55 
 
 
479 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  36.84 
 
 
507 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  33 
 
 
475 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>