231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01910 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND01910  conserved hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  494  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06676  transformer-SR ribonucleoprotein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05260)  45.65 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03870  transformer-2-beta isoform 3, putative  37.82 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02490  hypothetical protein  40.22 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.471511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  45 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4128  RNP-1 like RNA-binding protein  43.68 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3486  RNP-1 like RNA-binding protein  43.68 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  46.05 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  42.53 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  43.68 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  45 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  43.75 
 
 
176 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  41.25 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4894  RNA recognition motif-containing protein  41.38 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000987848  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4105  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0624  RNA recognition motif-containing protein  41.38 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2455  RNA recognition motif-containing protein  45 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.644837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03180  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1394  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
95 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000346845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2962  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
102 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.177581  normal  0.715358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2389  RNP-1 like RNA-binding protein  42.31 
 
 
102 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  43.42 
 
 
116 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23959  predicted protein  39.51 
 
 
605 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  44.16 
 
 
114 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1240  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
82 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  38.96 
 
 
119 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  42.5 
 
 
123 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4342  RNP-1 like RNA-binding protein  36.78 
 
 
92 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621123  hitchhiker  0.00155097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0106  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
90 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  41.38 
 
 
124 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2980  RNP-1 like RNA-binding protein  33.33 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0728065  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4127  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
121 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3485  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
121 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0967  RNP-1 like RNA-binding protein  33.96 
 
 
221 aa  62  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191765  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
137 aa  62  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  37.08 
 
 
90 aa  62  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  41.25 
 
 
95 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
90 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
90 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  35.06 
 
 
90 aa  60.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0149  RNP-1 like RNA-binding protein  39.08 
 
 
122 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  37.66 
 
 
89 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  38.96 
 
 
108 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2407  RNA binding protein  39.73 
 
 
143 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1303  RNP-1 like RNA-binding protein  41.1 
 
 
114 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90501  Polyadenylate-binding protein, cytoplasmic and nuclear (Poly(A)-binding protein) (PABP) (ARS consensus binding protein ACBP-67) (Polyadenylate tail-binding protein)  37.65 
 
 
632 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.528167  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  36.84 
 
 
96 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  35.96 
 
 
90 aa  60.1  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6779  RNP-1 like RNA-binding protein  37.04 
 
 
207 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  37.5 
 
 
104 aa  59.7  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  37.66 
 
 
90 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0356  RNA recognition motif-containing protein  38.75 
 
 
103 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0992503  normal  0.0823842 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  37.18 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  38.82 
 
 
97 aa  58.9  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04330  ribosome biogenesis (Nop4), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06250)  35.23 
 
 
724 aa  58.9  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42828  predicted protein  39.24 
 
 
499 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4234  RNA-binding region RNP-1  37.93 
 
 
140 aa  58.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0093  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
90 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0088  RNA recognition motif-containing protein  41.1 
 
 
99 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
98 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  36.26 
 
 
101 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38809  predicted protein  35.65 
 
 
319 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000594517  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2673  RNP-1 like RNA-binding protein  39.73 
 
 
90 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  39.47 
 
 
98 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12693  predicted protein  29.22 
 
 
151 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689101  normal  0.262863 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20857  predicted protein  29.27 
 
 
687 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.821409  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_68431  predicted protein  34.62 
 
 
481 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.326918  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3437  RNP-1 like RNA-binding protein  29.81 
 
 
158 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369251 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1324  RNA-binding protein  40 
 
 
107 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  33.77 
 
 
90 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  39.47 
 
 
102 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_25920  predicted protein  36.99 
 
 
424 aa  56.2  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0604247  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2194  RNP-1 like RNA-binding protein  38.16 
 
 
101 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50098  predicted protein  34.25 
 
 
572 aa  55.8  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442075  normal  0.11137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
99 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  42.86 
 
 
89 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4045  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
196 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.847138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  37.97 
 
 
88 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3960  RNP-1 like RNA-binding protein  38.46 
 
 
195 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000285938  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0627  RNA-binding protein  36.84 
 
 
97 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236494 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  40.26 
 
 
103 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  38.36 
 
 
85 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  36.84 
 
 
107 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
94 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  34.48 
 
 
94 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
87 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  35.96 
 
 
88 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1256  RNP-1 like RNA-binding protein  42.5 
 
 
86 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.737942  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  35.53 
 
 
105 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  36.84 
 
 
97 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1253  RNP-1 like RNA-binding protein  33.75 
 
 
134 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000895095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  36.36 
 
 
109 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1573  RNA recognition motif-containing protein  35 
 
 
112 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1930  RNA-binding region RNP-1  38.67 
 
 
89 aa  53.9  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07706  RNA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08310)  28.45 
 
 
328 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  36.36 
 
 
91 aa  52.8  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>