153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2475 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0163393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0528  YCII-related  85.09 
 
 		 114 aa  204  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0567  YCII-related protein  72.57 
 
 		 111 aa  169  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115419  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2781  YCII-related protein  51.75 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.496959  normal  0.164771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5356  YCII-related protein  42.24 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0755  YCII-related protein  45.22 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0273  DGPFAETKE family protein  43.59 
 
 		 112 aa  87.8  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1214  YCII-related  35.65 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1350  hypothetical protein  34.69 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2507  YCII-related protein  36.46 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.521642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0561  YCII-related protein  32.17 
 
 		 115 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4313  DGPFAETKE domain-containing protein  34.78 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1111  YCII-related  39.76 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3338  DGPFAETKE family protein  34.82 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0729969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2336  YCII-related  34.71 
 
 		 118 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000398459  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  33.64 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4112  YCII-related protein  33.65 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.423036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2366  DGPFAETKE family protein  35.71 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5546  DGPFAETKE family protein  29.13 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112549  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2170  YCII-related protein  39.47 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.87091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3323  YCII-related protein  33.72 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0170058  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  33.01 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  31.58 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0382  YCII-related protein  37.1 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00477239  decreased coverage  0.00575194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0955  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  normal  0.159018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2534  DGPFAETKE family protein  30.34 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490619  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  30.53 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4555  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1334  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  32.65 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  35.19 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0198  YCII-related protein  28.83 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.0536776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  29.47 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1112  YCII-related  37.97 
 
 		 118 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0499919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2256  YCII-related protein  34.92 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5202  YCII-related protein  31 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal  0.501323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4062  DGPFAETKE family protein  30.09 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3461  hypothetical protein  31.62 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  hitchhiker  0.00155442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  29.47 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4492  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.891813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0472  YCII-related protein  35 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354888  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2210  YCII-related protein  35.8 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0260  hypothetical protein  29.81 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3428  DGPFAETKE domain-containing protein  35.29 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1441  DGPF domain-containing protein  29.81 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1638  DGPF domain-containing protein  29.81 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2497  DGPF domain-containing protein  29.81 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0293  DGPF domain-containing protein  29.81 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.493225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  27.59 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4227  YCII-related protein  41.27 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  36.21 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8665  YCII-related protein  35.29 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3346  DGPFAETKE family protein  33.04 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119641  normal  0.552539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6650  DGPFAETKE family protein  39.13 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.96352  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0960  DGPFAETKE family protein  33.73 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  48.72 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3850  DGPFAETKE family protein  28.32 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  31.52 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2503  YCII-related protein  33.33 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  46.3 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0931  DGPF domain-containing protein  30.21 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4175  hypothetical protein  42.31 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  34.25 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4454  DGPFAETKE domain-containing protein  28.7 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2635  DGPF domain-containing protein  30.21 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.230357  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0533  DGPF domain-containing protein  31.52 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  38.98 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6898  hypothetical protein  37.21 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  46 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4928  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0813146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4218  DGPFAETKE family protein  42.31 
 
 		 118 aa  43.5  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.780161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1521  hypothetical protein  29.82 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.411224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4943  DGPFAETKE family protein  37.68 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4327  DGPFAETKE  26.55 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3474  YCII-related  32.22 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  26.42 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3017  hypothetical protein  40.32 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.376227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5537  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1832  YCII-related protein  46.43 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1406  YCII-related protein  43.75 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48237  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2236  YCII-related protein  55 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.352695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  34.72 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  33.33 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3338  YCII-related  30.43 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000178684  normal  0.0154405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  37.04 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3712  DGPFAETKE family protein  42.86 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.555531  normal  0.297001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  35.19 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3057  YCII-related protein  39.39 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00227791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0961  DGPFAETKE family protein  35.94 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1747  YCII-related  34.21 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  48.65 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>