More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1504 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  41.83 
 
 		 1047 aa  880    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.83 
 
 		 1047 aa  880    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.8 
 
 		 1034 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  54.85 
 
 		 1045 aa  1201    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  36.96 
 
 		 1034 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  43.68 
 
 		 1055 aa  909    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  41.68 
 
 		 1100 aa  857    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  42.83 
 
 		 1052 aa  881    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  46.4 
 
 		 1043 aa  993    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  36.03 
 
 		 1032 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0355  CzcA family heavy metal efflux protein  43.12 
 
 		 1044 aa  889    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  45.79 
 
 		 1066 aa  987    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  42.33 
 
 		 1045 aa  893    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  43.72 
 
 		 1047 aa  922    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  46.21 
 
 		 1069 aa  973    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  43.3 
 
 		 1068 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  44.83 
 
 		 1052 aa  919    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  42.04 
 
 		 1045 aa  890    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  42.44 
 
 		 1045 aa  885    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  42.99 
 
 		 1070 aa  898    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  42.99 
 
 		 1070 aa  898    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  43.82 
 
 		 1039 aa  909    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  44.35 
 
 		 1047 aa  924    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  42.74 
 
 		 1050 aa  901    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  43.61 
 
 		 1049 aa  899    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  42.98 
 
 		 1063 aa  910    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  42.93 
 
 		 1052 aa  891    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  35.51 
 
 		 1032 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  47.07 
 
 		 1051 aa  993    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  47.17 
 
 		 1044 aa  996    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  35.07 
 
 		 1032 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  42.99 
 
 		 1070 aa  897    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  46.4 
 
 		 1059 aa  992    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4833  CzcA family heavy metal efflux protein  46.19 
 
 		 1056 aa  964    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  40.98 
 
 		 1060 aa  858    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  44.81 
 
 		 1056 aa  928    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  46.1 
 
 		 1058 aa  945    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  43.39 
 
 		 1070 aa  895    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  42.37 
 
 		 1049 aa  899    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  52.28 
 
 		 1046 aa  1132    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  44.23 
 
 		 1040 aa  924    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  43.56 
 
 		 1067 aa  903    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  42.97 
 
 		 1074 aa  894    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  42.93 
 
 		 1056 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  46.21 
 
 		 1057 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  44.52 
 
 		 1074 aa  952    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  42.99 
 
 		 1070 aa  897    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  53.99 
 
 		 1045 aa  1194    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.51 
 
 		 1034 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  33.93 
 
 		 1046 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  45.73 
 
 		 1042 aa  946    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  45.18 
 
 		 1054 aa  899    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  42.77 
 
 		 1048 aa  893    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  42.87 
 
 		 1015 aa  805    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  42.08 
 
 		 1049 aa  893    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.39 
 
 		 1040 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  43.99 
 
 		 1059 aa  966    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  42.99 
 
 		 1070 aa  898    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  42.61 
 
 		 1045 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  54.41 
 
 		 1048 aa  1203    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  42.99 
 
 		 1070 aa  898    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  43.5 
 
 		 1094 aa  899    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  46.44 
 
 		 1051 aa  956    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  47.26 
 
 		 1043 aa  1010    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  43.73 
 
 		 1039 aa  914    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  42.68 
 
 		 1047 aa  900    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  43.74 
 
 		 1047 aa  914    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  43.7 
 
 		 1042 aa  880    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  45.62 
 
 		 1052 aa  957    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  34.86 
 
 		 1031 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4173  CzcA family heavy metal efflux protein  42.08 
 
 		 1049 aa  894    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  43.19 
 
 		 1048 aa  889    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  43.42 
 
 		 1056 aa  902    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  42.78 
 
 		 1091 aa  885    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  44.04 
 
 		 1042 aa  905    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  44.56 
 
 		 1038 aa  915    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  45.34 
 
 		 1043 aa  940    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  44.35 
 
 		 1061 aa  892    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  42.5 
 
 		 1039 aa  897    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.86 
 
 		 1455 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  46.33 
 
 		 1060 aa  952    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  46.34 
 
 		 1065 aa  959    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  45.98 
 
 		 1063 aa  960    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  42.61 
 
 		 1045 aa  893    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  47.01 
 
 		 1060 aa  962    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  43.68 
 
 		 1068 aa  897    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  43.74 
 
 		 1056 aa  918    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4264  CzcA family heavy metal efflux protein  43.35 
 
 		 1092 aa  897    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0061881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.27 
 
 		 1032 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  43.61 
 
 		 1055 aa  933    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  42.28 
 
 		 1044 aa  863    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  42.57 
 
 		 1044 aa  862    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  42.12 
 
 		 1047 aa  881    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  43.2 
 
 		 1048 aa  889    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  43.68 
 
 		 1068 aa  897    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  44.23 
 
 		 1045 aa  888    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  46.1 
 
 		 1058 aa  956    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  42.46 
 
 		 1049 aa  899    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  55.52 
 
 		 1045 aa  1189    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  100 
 
 		 1049 aa  2111    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>