More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0660 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1254    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  36.08 
 
 		 599 aa  359  9e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  32.04 
 
 		 615 aa  289  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  31.32 
 
 		 617 aa  266  7e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  29.93 
 
 		 576 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 		 612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  29.84 
 
 		 602 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  28.47 
 
 		 619 aa  203  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  29.65 
 
 		 616 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 		 618 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 602 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  26.33 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  25.65 
 
 		 589 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  39.15 
 
 		 218 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  27.99 
 
 		 668 aa  120  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  27.94 
 
 		 668 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  25.66 
 
 		 668 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  27.98 
 
 		 669 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 592 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  23.73 
 
 		 578 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  31.1 
 
 		 248 aa  104  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 621 aa  99.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  21.92 
 
 		 589 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  22.84 
 
 		 589 aa  98.6  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  25.89 
 
 		 697 aa  96.3  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  23.25 
 
 		 641 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  25.52 
 
 		 661 aa  94.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 661 aa  94  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 661 aa  94  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 661 aa  94  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 661 aa  94  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  24.95 
 
 		 661 aa  94  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 661 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  25.33 
 
 		 661 aa  92.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 574 aa  91.3  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  23.26 
 
 		 565 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  24.17 
 
 		 596 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  23.03 
 
 		 610 aa  87.4  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  30.92 
 
 		 275 aa  87.4  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  36.9 
 
 		 587 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  23.25 
 
 		 602 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  23.12 
 
 		 723 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  23.83 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  23.51 
 
 		 619 aa  85.1  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  25.92 
 
 		 671 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  23.58 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  32.66 
 
 		 239 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  31.07 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  23.64 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  22.86 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  22.84 
 
 		 599 aa  80.5  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  22.3 
 
 		 594 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  33.18 
 
 		 604 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  22.5 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  24.85 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  23.24 
 
 		 725 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  26.33 
 
 		 581 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  22.6 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.02 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  23.25 
 
 		 616 aa  77.4  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  32.42 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  23.31 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  28.5 
 
 		 212 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  31.91 
 
 		 247 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  23.24 
 
 		 706 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  25.27 
 
 		 740 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  25.27 
 
 		 740 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  30.21 
 
 		 226 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  22.31 
 
 		 617 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  26.57 
 
 		 709 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  23.61 
 
 		 676 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  22.22 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  22.4 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  25.13 
 
 		 790 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  25.06 
 
 		 680 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  24.43 
 
 		 682 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  22.05 
 
 		 741 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  25.09 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  23.99 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  23.16 
 
 		 714 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  22.42 
 
 		 656 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  23.29 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  21.23 
 
 		 643 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  23.03 
 
 		 687 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  23.03 
 
 		 687 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  23.03 
 
 		 687 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  24.14 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  24.73 
 
 		 611 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  24.26 
 
 		 646 aa  72.4  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  27.51 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  22.3 
 
 		 694 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 576 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  23.26 
 
 		 596 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  28.49 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  26.81 
 
 		 693 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  21.89 
 
 		 692 aa  71.6  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  21.89 
 
 		 741 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  21.31 
 
 		 646 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1195  ribosomal protein L7/L12  22.24 
 
 		 860 aa  71.2  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191109  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 		 731 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>