More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0970 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0970  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  100 
 
 
226 aa  458  9.999999999999999e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.542605  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0750  undecaprenyl diphosphate synthase  60.44 
 
 
225 aa  282  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.397744  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0695  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  64.89 
 
 
223 aa  274  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0997  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  54.87 
 
 
225 aa  247  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0978  undecaprenyl diphosphate synthetase  49.33 
 
 
222 aa  230  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.911321  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  50.22 
 
 
228 aa  227  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2344  undecaprenyl diphosphate synthase  47.58 
 
 
227 aa  222  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0350605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.7 
 
 
252 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.46 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1454  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
275 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000365113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2898  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
275 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00271484  normal  0.168687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1485  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
275 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000335348  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1449  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
275 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000030821  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0911  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.220596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0841  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1956  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 
228 aa  215  4e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1190  undecaprenyl diphosphate synthase  46.19 
 
 
222 aa  214  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0848371  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  44.05 
 
 
312 aa  214  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1352  undecaprenyl diphosphate synthase  48.02 
 
 
275 aa  214  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1495  undecaprenyl diphosphate synthase  44.3 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.595804  normal  0.585413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2704  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.26 
 
 
275 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000108534  hitchhiker  0.00267943 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  46.81 
 
 
240 aa  208  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2637  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.26 
 
 
275 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000140247  normal  0.0415096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2811  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.26 
 
 
275 aa  208  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000658443  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1633  undecaprenyl diphosphate synthase  46.7 
 
 
275 aa  207  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
264 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1143  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  46.05 
 
 
266 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716558  normal  0.11799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  45.81 
 
 
263 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1712  undecaprenyl diphosphate synthase  43.11 
 
 
252 aa  205  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 
234 aa  205  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.78 
 
 
249 aa  205  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1533  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.67 
 
 
252 aa  204  8e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.554505  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.89 
 
 
249 aa  204  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.17 
 
 
258 aa  204  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
266 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
261 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1274  undecaprenyl diphosphate synthase  44.44 
 
 
274 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.278229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  43.42 
 
 
257 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  43.86 
 
 
240 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
260 aa  202  3e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  44.54 
 
 
232 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.37 
 
 
258 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  44.93 
 
 
264 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  42.73 
 
 
251 aa  201  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1253  undecaprenyl diphosphate synthase  45.13 
 
 
246 aa  201  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.200371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.09 
 
 
236 aa  201  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  41.82 
 
 
255 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.37 
 
 
246 aa  201  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002750  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.78 
 
 
251 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0104222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  44.69 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.24 
 
 
254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03233  undecaprenyl diphosphate synthase  45.33 
 
 
251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.44 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  43.81 
 
 
282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.29 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4944  undecaprenyl diphosphate synthase  41.74 
 
 
248 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.371798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.41 
 
 
258 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  43.95 
 
 
244 aa  199  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  43.05 
 
 
225 aa  199  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2707  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.73 
 
 
247 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  42.11 
 
 
264 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1364  undecaprenyl diphosphate synthase  42.73 
 
 
247 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  43.56 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  198  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  198  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  198  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.89 
 
 
249 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.15 
 
 
246 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
258 aa  198  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.17 
 
 
257 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  42.73 
 
 
238 aa  198  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  198  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4063  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.64 
 
 
236 aa  198  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
257 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.67 
 
 
255 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1762  undecaprenyl diphosphate synthase  42.01 
 
 
240 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430712  normal  0.0678846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
258 aa  197  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2031  undecaprenyl diphosphate synthase  41.52 
 
 
260 aa  197  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.81 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3193  undecaprenyl diphosphate synthase  42.67 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0231414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  41.15 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1252  undecaprenyl diphosphate synthase  42.22 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1412  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.11 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.904753  normal  0.207147 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0983  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.93 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017531  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  41.78 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.42 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  44.25 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00394287  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09951  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.73 
 
 
265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1334  undecaprenyl diphosphate synthase  40 
 
 
260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.17 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.17 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2489  undecaprenyl diphosphate synthase  41.07 
 
 
260 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.85 
 
 
251 aa  196  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2691  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  42.47 
 
 
246 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  0.513903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0464  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.37 
 
 
248 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  41.33 
 
 
273 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>