More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0500 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0500  peptide chain release factor 2  100 
 
 		 364 aa  745    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1369  peptide chain release factor 2  70.6 
 
 		 369 aa  550  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0584  peptide chain release factor 2  70.56 
 
 		 366 aa  526  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1628  peptide chain release factor 2  69.81 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1448  peptide chain release factor 2  70 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0251  peptide chain release factor 2  69.51 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1790  peptide chain release factor 2  70.28 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.801319  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  65.56 
 
 		 364 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0259  peptide chain release factor 2  70.28 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  59.56 
 
 		 365 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  50.28 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  50.28 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1031  peptide chain release factor 2  52.42 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158177  normal  0.214686 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  51.21 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  52.41 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 391 aa  358  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  51.82 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 		 357 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  48.01 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 417 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  51.21 
 
 		 406 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  50.91 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  49.12 
 
 		 357 aa  352  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  47.73 
 
 		 367 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  50.91 
 
 		 359 aa  352  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  47.79 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  49.27 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  47.51 
 
 		 367 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  50.91 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  49.7 
 
 		 349 aa  345  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0721  hypothetical protein  50.75 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 349 aa  344  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  48.99 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0725  peptide chain release factor 2  49.54 
 
 		 332 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159955  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 354 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  46.09 
 
 		 375 aa  340  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1805  peptide chain release factor 2  51.52 
 
 		 354 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 330 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  53.18 
 
 		 312 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  45.33 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1247  peptide chain release factor 2  52.02 
 
 		 326 aa  339  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.0405299999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 372 aa  339  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  47.51 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 344 aa  338  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  50.3 
 
 		 376 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  50.3 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  47.62 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  49.08 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  48.34 
 
 		 367 aa  335  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  50.3 
 
 		 365 aa  335  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  50.3 
 
 		 365 aa  335  7.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  47.5 
 
 		 383 aa  335  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1823  peptide chain release factor 2  50.61 
 
 		 374 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.366518  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  49.85 
 
 		 372 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  49.71 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  44.6 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 375 aa  333  3e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  49.39 
 
 		 365 aa  333  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  49.84 
 
 		 317 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  44.9 
 
 		 367 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  51.31 
 
 		 322 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  47.8 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  48.29 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  51.99 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  46.48 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  45.61 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  50 
 
 		 340 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  48.66 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  46.78 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  48 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  49.39 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  49.23 
 
 		 377 aa  329  6e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  47.72 
 
 		 332 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  52.56 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4083  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  45.74 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.963626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2773  peptide chain release factor 2  47.88 
 
 		 355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  49.51 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2731  hypothetical protein  47.49 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0838  peptide chain release factor 2  48.9 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  47.43 
 
 		 371 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 381 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  42.86 
 
 		 365 aa  327  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5845  peptide chain release factor 2  50.82 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  0.711564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  47.58 
 
 		 378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  45.25 
 
 		 366 aa  325  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1762  peptide chain release factor 2  49.58 
 
 		 364 aa  325  7e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000512072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4200  peptide chain release factor 2  50.65 
 
 		 323 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  48.18 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  48.18 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>