More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0241 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0241  30S ribosomal protein S6  100 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  76.38 
 
 		 128 aa  197  3e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1585  30S ribosomal protein S6  66.9 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1998  30S ribosomal protein S6  69.84 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  75.89 
 
 		 125 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  75.89 
 
 		 125 aa  176  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  75 
 
 		 125 aa  174  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  74.55 
 
 		 124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0863  ribosomal protein S6  58.65 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  49.52 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  47.12 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  39.8 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  39.18 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  40.57 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  38.61 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0107  30S ribosomal protein S6  43.33 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000236636  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0114  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0147  30S ribosomal protein S6  41.11 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000969846  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0184  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2512  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  40.86 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0094  30S ribosomal protein S6  41.76 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  43.82 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  32.98 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  37.93 
 
 		 93 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3465  30S ribosomal protein S6  31.94 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0414  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0162  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000193199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0158  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000097337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 153 aa  67  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  37.78 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3774  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4962  ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 109 aa  66.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 107 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  31.11 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  30.6 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  34.78 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2512  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  32.65 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1970  ribosomal protein S6  38.89 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00222496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  33.67 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0308  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.389439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>