More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1657 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1657  nickel import ATP-binding protein NikE  100 
 
 
219 aa  442  1e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  40.43 
 
 
542 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  36.44 
 
 
602 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  37.45 
 
 
532 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7187  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.08 
 
 
313 aa  151  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3964  ABC transporter related  39.81 
 
 
255 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.833347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4132  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.58 
 
 
322 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4448  ABC transporter related  36.8 
 
 
287 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.338055  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1954  ABC transporter related  37.72 
 
 
283 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
547 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.43 
 
 
313 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3964  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.02 
 
 
268 aa  148  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  39.02 
 
 
268 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3841  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.02 
 
 
268 aa  149  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.02 
 
 
268 aa  148  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  39.02 
 
 
268 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.02 
 
 
268 aa  148  5e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  34.68 
 
 
544 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 
308 aa  147  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  39.02 
 
 
268 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  35.27 
 
 
268 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0235  nickel import ATP-binding protein NikE  39.02 
 
 
268 aa  147  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4820  nickel transporter ATP-binding protein NikE  38.54 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
308 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.06 
 
 
333 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  34.91 
 
 
546 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.53 
 
 
619 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  34.45 
 
 
566 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0876  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  35.38 
 
 
345 aa  145  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  33.19 
 
 
534 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 
308 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
292 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0775  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  32.61 
 
 
322 aa  145  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138989  hitchhiker  0.00000000000731431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
308 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
308 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
308 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
308 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.8 
 
 
328 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 
308 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5404  ABC transporter related  34.23 
 
 
544 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.235507  decreased coverage  0.00147169 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.7 
 
 
600 aa  144  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375029  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1327  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
322 aa  144  9e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0010224  normal  0.375909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 
594 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488262  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  36.14 
 
 
545 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
257 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0232  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
257 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  36.7 
 
 
571 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
257 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.09 
 
 
323 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.28 
 
 
257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  36.07 
 
 
308 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0906  putative ATP-binding component of dipeptide transport system  33.48 
 
 
330 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0105903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.42 
 
 
326 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  32.88 
 
 
547 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  37.8 
 
 
207 aa  142  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  35.45 
 
 
254 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3302  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.76 
 
 
326 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.11 
 
 
674 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  35.19 
 
 
674 aa  141  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  32.46 
 
 
558 aa  141  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
257 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
257 aa  141  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3794  ABC transporter related  33.9 
 
 
377 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
257 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  32.74 
 
 
576 aa  141  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  33.64 
 
 
571 aa  141  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  34.42 
 
 
248 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0688  ABC transporter related  40.38 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.873107  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1233  methionine import ATP-binding protein MetN  39.45 
 
 
340 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  36.4 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2467  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.47 
 
 
695 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.380053  normal  0.0115313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3024  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  31.51 
 
 
346 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.82 
 
 
616 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4370  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 
338 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.737852  normal  0.846843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
329 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  34.45 
 
 
577 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1770  ABC transporter related  40.38 
 
 
234 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.529989  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0749  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 
312 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.760141  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.3 
 
 
354 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
539 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  32.39 
 
 
246 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.61 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  35.96 
 
 
552 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  30.84 
 
 
609 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.31 
 
 
326 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  33.92 
 
 
541 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3078  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.41 
 
 
338 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111325  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  35.27 
 
 
552 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0429  ABC transporter related  33.66 
 
 
269 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4408  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.56 
 
 
333 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  33.49 
 
 
552 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 
257 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2120  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.92 
 
 
322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3447  ABC transporter related  31.16 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.491828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  37.61 
 
 
579 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  33.48 
 
 
550 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1618  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  34.33 
 
 
322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.231064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>