More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1770 on replicon NC_013164
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013164  Apre_1770  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.529989  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0688  ABC transporter related  100 
 
 
234 aa  464  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.873107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 
557 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  38.83 
 
 
571 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  38.1 
 
 
573 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
315 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.758275  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0489  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  36.89 
 
 
674 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.62 
 
 
336 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0863  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
326 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  35.65 
 
 
665 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4382  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  37.1 
 
 
323 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.71885e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1004  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
323 aa  158  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0826  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
326 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0912  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.1 
 
 
323 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0807  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 
323 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0949  oligopeptide transport ATP-binding protein AppF  37.1 
 
 
323 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1000  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
323 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.90335e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0811  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
326 aa  158  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 
313 aa  158  9e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  33.33 
 
 
563 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0943  ABC transporter related protein  37.16 
 
 
315 aa  156  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6371  ABC transporter related  36.28 
 
 
544 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1707  ABC transporter related  36.28 
 
 
544 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1618  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  37.79 
 
 
322 aa  155  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.231064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
594 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.92 
 
 
534 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.6 
 
 
546 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  35.05 
 
 
561 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  35.68 
 
 
565 aa  154  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4998  ABC transporter, ATPase subunit  36.11 
 
 
547 aa  154  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  36.87 
 
 
549 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1631  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 
349 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1722  ABC transporter related  35.81 
 
 
544 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.185167  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0775  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  35.32 
 
 
322 aa  154  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138989  hitchhiker  0.00000000000731431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2776  ABC transporter related  36.05 
 
 
539 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0257  oligopeptide ABC transporter ATPase  35.89 
 
 
669 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.691282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  34.25 
 
 
532 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1040  ABC transporter related  35.4 
 
 
276 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1634  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
334 aa  153  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.666215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0372  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 
323 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0048  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.76 
 
 
336 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0035  ABC transporter related  35.04 
 
 
543 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  35.56 
 
 
308 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1107  ABC transporter related  34.96 
 
 
277 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
276 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 
282 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  38.53 
 
 
313 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0053  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.23 
 
 
336 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.146375  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  38.53 
 
 
313 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.09 
 
 
444 aa  152  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0310035 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  36.92 
 
 
545 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  38.16 
 
 
628 aa  151  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  38.56 
 
 
312 aa  151  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  34.88 
 
 
546 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1075  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.2 
 
 
319 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  34.55 
 
 
643 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  35.81 
 
 
559 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  35.38 
 
 
531 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.77 
 
 
335 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.03 
 
 
388 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  34.56 
 
 
544 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  35.35 
 
 
558 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0233  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.06 
 
 
342 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  35.98 
 
 
545 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.17 
 
 
328 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  35.51 
 
 
545 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.33 
 
 
547 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 
358 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3946  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
337 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0840867  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0292  ABC transporter, ATPase subunit  34.04 
 
 
545 aa  150  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 
358 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
337 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  35.35 
 
 
555 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  38.03 
 
 
239 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
337 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 
358 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3824  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
337 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.33 
 
 
339 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0845  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 
358 aa  150  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
334 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4006  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
337 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 
543 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  38.29 
 
 
561 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.22 
 
 
334 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4688  ABC transporter related  36.07 
 
 
533 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.275572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 
334 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1041  peptide ABC transporter ATPase  37.39 
 
 
565 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.571096 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.74 
 
 
221 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.26 
 
 
342 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  35.05 
 
 
545 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  34.8 
 
 
588 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0382  ABC transporter related  35.51 
 
 
543 aa  148  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.7 
 
 
623 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>