More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1753 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1319  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  58.1 
 
 
658 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179908  normal  0.0765459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2030  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  66.83 
 
 
642 aa  753    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.622365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0936  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  55.3 
 
 
615 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2293  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  62.01 
 
 
695 aa  687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2331  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  55.87 
 
 
699 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1753  ATPase component ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system  100 
 
 
628 aa  1239    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  55.1 
 
 
659 aa  595  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  50.41 
 
 
602 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  50.08 
 
 
603 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.76 
 
 
703 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.83 
 
 
708 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.48 
 
 
674 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.1 
 
 
540 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0890  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.08 
 
 
690 aa  526  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  47.54 
 
 
712 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  43.77 
 
 
620 aa  506  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  46.63 
 
 
615 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4532  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
736 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.790856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  47.3 
 
 
599 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8315  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 
711 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.718859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  49.02 
 
 
571 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  46.88 
 
 
613 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  44.2 
 
 
611 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
637 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.27 
 
 
626 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  44.19 
 
 
610 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.04 
 
 
611 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 
677 aa  483  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  47.8 
 
 
619 aa  483  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
601 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  43.97 
 
 
611 aa  482  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3806  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.18 
 
 
749 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
625 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  41.17 
 
 
609 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.68 
 
 
676 aa  480  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 
625 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  43.42 
 
 
611 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.69 
 
 
583 aa  477  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2773  ABC transporter, ATPase subunit  45.95 
 
 
558 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.68 
 
 
632 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.09 
 
 
619 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.22 
 
 
640 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.29 
 
 
632 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  44.75 
 
 
612 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 
623 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  38.92 
 
 
564 aa  474  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  48.36 
 
 
613 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.95 
 
 
640 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  48.2 
 
 
579 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  47.14 
 
 
611 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  41.51 
 
 
617 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
649 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.83 
 
 
633 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 
756 aa  474  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.14 
 
 
611 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  45.04 
 
 
686 aa  475  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  44.28 
 
 
597 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 
611 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  45.71 
 
 
627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0950  ABC transporter related  45.07 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331965  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1112  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.52 
 
 
662 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.663685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5592  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.24 
 
 
725 aa  471  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854543  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.75 
 
 
643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  46.12 
 
 
630 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  44.57 
 
 
624 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.05 
 
 
611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115174  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.46 
 
 
617 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 
633 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.1 
 
 
596 aa  468  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  43.81 
 
 
624 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  43 
 
 
578 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.24 
 
 
631 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 
633 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1854  ATPase components of various ABC-type transport systems, contain duplicated ATPase  48.31 
 
 
664 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
623 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
623 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8310  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.21 
 
 
620 aa  465  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  44.77 
 
 
623 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0974  putative dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 
662 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0802762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 
623 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  39.84 
 
 
627 aa  465  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  45.47 
 
 
633 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2815  glutathione transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
623 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.990596  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
665 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0887  glutathione transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
623 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
623 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.02 
 
 
619 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
623 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0854  glutathione transporter ATP-binding protein  44.93 
 
 
623 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4432  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 
611 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.62214  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0404  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 
679 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0237  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 
673 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1361  putative glutathione ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 
673 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00796  fused predicted peptide transport subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.91 
 
 
612 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.885832  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  39.32 
 
 
617 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11307  oligopeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter oppD  46.27 
 
 
612 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.61 
 
 
671 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00813  hypothetical protein  44.91 
 
 
612 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.991571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  44.87 
 
 
593 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 
623 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>