More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1757 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  56.26 
 
 
739 aa  866    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  56.26 
 
 
739 aa  865    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  52.71 
 
 
738 aa  795    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.22 
 
 
745 aa  706    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  55.99 
 
 
739 aa  857    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 
759 aa  1533    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  80.77 
 
 
751 aa  1191    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  61.82 
 
 
757 aa  976    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  55.63 
 
 
749 aa  847    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0660  surface antigen (D15)  41.24 
 
 
755 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665209  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.05 
 
 
808 aa  326  9e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  29.51 
 
 
751 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.53 
 
 
765 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  29.74 
 
 
763 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.48 
 
 
802 aa  320  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  29 
 
 
752 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.5 
 
 
892 aa  302  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.92 
 
 
752 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.09 
 
 
895 aa  299  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.45 
 
 
769 aa  295  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.05 
 
 
913 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  27.87 
 
 
785 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  27.76 
 
 
763 aa  279  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  28.82 
 
 
806 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.68 
 
 
793 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.74 
 
 
793 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  26.89 
 
 
767 aa  270  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  28.18 
 
 
777 aa  270  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.53 
 
 
895 aa  266  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.85 
 
 
781 aa  266  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  25.85 
 
 
781 aa  266  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  26.23 
 
 
893 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.87 
 
 
770 aa  262  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  26.83 
 
 
820 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.16 
 
 
767 aa  260  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.49 
 
 
750 aa  257  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.36 
 
 
765 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.74 
 
 
770 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  28.03 
 
 
765 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.65 
 
 
769 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.32 
 
 
770 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  27.19 
 
 
768 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  27.19 
 
 
769 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  27.19 
 
 
768 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  27.19 
 
 
769 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  27.19 
 
 
769 aa  252  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  27.32 
 
 
768 aa  252  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  27.19 
 
 
768 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  27.19 
 
 
768 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
768 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.24 
 
 
768 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.58 
 
 
769 aa  251  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.86 
 
 
769 aa  251  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
769 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
769 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
769 aa  250  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  27.6 
 
 
896 aa  250  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.36 
 
 
785 aa  250  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.77 
 
 
758 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  27.26 
 
 
785 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.8 
 
 
797 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.14 
 
 
780 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  25.65 
 
 
794 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.5 
 
 
803 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.99 
 
 
801 aa  244  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.13 
 
 
888 aa  244  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  26.39 
 
 
772 aa  244  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.38 
 
 
800 aa  244  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  26.98 
 
 
799 aa  243  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  26.56 
 
 
791 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.43 
 
 
803 aa  242  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.78 
 
 
784 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  24.97 
 
 
790 aa  241  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  27.3 
 
 
781 aa  240  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.25 
 
 
784 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.45 
 
 
761 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  25.85 
 
 
781 aa  239  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.45 
 
 
799 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.55 
 
 
779 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  24.91 
 
 
786 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  24.91 
 
 
786 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.55 
 
 
815 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.47 
 
 
791 aa  237  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.34 
 
 
778 aa  236  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.34 
 
 
790 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.05 
 
 
795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.62 
 
 
765 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.05 
 
 
795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.05 
 
 
795 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.89 
 
 
809 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  26.92 
 
 
778 aa  234  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  25.16 
 
 
787 aa  234  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.41 
 
 
800 aa  234  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.03 
 
 
787 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.79 
 
 
769 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  24.9 
 
 
796 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  25.03 
 
 
785 aa  232  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  25.03 
 
 
787 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  24.74 
 
 
794 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.94 
 
 
784 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>