More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0226 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  79.23 
 
 		 414 aa  691    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1350  serine hydroxymethyltransferase  93.72 
 
 		 414 aa  814    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  78.99 
 
 		 414 aa  691    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  77.18 
 
 		 415 aa  681    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  84.5 
 
 		 415 aa  733    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 414 aa  855    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1274  serine hydroxymethyltransferase  77.43 
 
 		 415 aa  665    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020051  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  79.23 
 
 		 414 aa  692    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  78.16 
 
 		 413 aa  677    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  88.41 
 
 		 414 aa  771    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1947  serine hydroxymethyltransferase  73.61 
 
 		 420 aa  623  1e-177  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 416 aa  498  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 414 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  55.96 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 419 aa  481  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 417 aa  481  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1402  glycine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 423 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.523534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.68 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 427 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 417 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  58.66 
 
 		 412 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  55.91 
 
 		 417 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 416 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3036  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.603855  normal  0.847682 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 414 aa  477  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  55.67 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2930  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0915  Glycine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2710  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 414 aa  471  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2817  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  55.39 
 
 		 425 aa  472  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2755  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.418331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>