More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0118 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 		 357 aa  728    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  79.55 
 
 		 357 aa  598  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  62.54 
 
 		 352 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.6 
 
 		 352 aa  441  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  59.94 
 
 		 351 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.39 
 
 		 352 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.39 
 
 		 352 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.1 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  56.82 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.39 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.11 
 
 		 361 aa  285  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  41.34 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  39.94 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  38.83 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  38.55 
 
 		 363 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.44 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.85 
 
 		 367 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  39.82 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.66 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  37.5 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.36 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  35.9 
 
 		 355 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.01 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  33.89 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  36.97 
 
 		 384 aa  246  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.16 
 
 		 357 aa  246  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.64 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  36.57 
 
 		 357 aa  245  6.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.18 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.54 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  37.7 
 
 		 370 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.24 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  34.25 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.52 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.34 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.57 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.27 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.27 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.27 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  38.05 
 
 		 349 aa  238  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  36.34 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  35.89 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  35.89 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.16 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.24 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.59 
 
 		 353 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.45 
 
 		 349 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.52 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.75 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.99 
 
 		 357 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  38.28 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  36.36 
 
 		 348 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1457  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.98 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1099  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000085324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1016  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1167  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0101504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1133  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000040512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1120  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.23 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00333644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  35.57 
 
 		 374 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.07 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.67 
 
 		 356 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.57 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  37.28 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.96 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0178  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.33 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.64 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  35.97 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  37.5 
 
 		 352 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.96 
 
 		 362 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.87 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.73 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.76 
 
 		 356 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  34.59 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.73 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.73 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.86 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.12 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.76 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.73 
 
 		 378 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.43 
 
 		 357 aa  222  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.84 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  37.54 
 
 		 377 aa  222  8e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.58 
 
 		 336 aa  222  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.73 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.65 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.11 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.57 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0940  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.49 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.365408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  39.02 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>