261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07340 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07340  LPS glycosyltransferase  100 
 
 
338 aa  698    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0293  glycosyl transferase, group 1  53.93 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283411  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
379 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  28.1 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
407 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
374 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 
819 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
406 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  18.55 
 
 
412 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
409 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
773 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
360 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  27.04 
 
 
398 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
772 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
388 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
353 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.82 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  24.67 
 
 
452 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3642  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
411 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
363 aa  54.3  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2859  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 
354 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.91 
 
 
408 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.91 
 
 
401 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.37 
 
 
363 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 
399 aa  53.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0055  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
376 aa  52.8  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.557703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
424 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.08 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
383 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.22 
 
 
465 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  20.66 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
401 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
496 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
351 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  28.37 
 
 
373 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3441  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
396 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 
689 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  34.35 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
355 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
426 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
358 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0305  putative glycosyl transferase  29.23 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2253  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
433 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
507 aa  50.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
421 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  24.64 
 
 
406 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.42 
 
 
377 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
376 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 
356 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  28.37 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.71 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  28.48 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3441  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
894 aa  49.7  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  23.78 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  25.53 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.56 
 
 
373 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08710  glycosyltransferase  26.32 
 
 
374 aa  49.3  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2585  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
388 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  0.530057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
391 aa  49.3  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0869  a-glycosyltransferase  33.33 
 
 
358 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.746857  normal  0.684774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
341 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
478 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.75 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.7 
 
 
350 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
743 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
403 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.28 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.98 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.22 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
404 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  25.78 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  25.62 
 
 
350 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  20.21 
 
 
812 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>