More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3441 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3441  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 396 aa  806    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  54.1 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  49.09 
 
 		 663 aa  363  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  28.64 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  27.31 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 820 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  26.99 
 
 		 803 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  28.02 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  28.02 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  28.02 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  28.92 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  30.05 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.82 
 
 		 1177 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.3 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  22.93 
 
 		 1177 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.54 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  30.05 
 
 		 350 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  30.29 
 
 		 745 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4717  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 		 893 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.337059  normal  0.0164521 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  36.72 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  27.45 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 744 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  29.94 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3441  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 		 894 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  32.4 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1913  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  29.94 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0697  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 772 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  31.25 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0690  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.945195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  30.3 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  26.39 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  32.58 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  27.98 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 819 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  27.98 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  30 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  27.98 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 399 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>