More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1099 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1099  putative epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00865955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80 
 
 
311 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.99 
 
 
323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.807379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.74 
 
 
299 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0546  putative epimerase/dehydratase  45 
 
 
297 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.680238  normal  0.619061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.14 
 
 
298 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2625  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.71 
 
 
296 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.45 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.5 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.19 
 
 
289 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.06 
 
 
295 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124899  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5331  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.54 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.65 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4718  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.71 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3645  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.71 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.51 
 
 
297 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.4 
 
 
297 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1486  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
298 aa  212  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 
297 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1649  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.89 
 
 
294 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0651828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.44 
 
 
296 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.44 
 
 
296 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159245  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.44 
 
 
296 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.4 
 
 
297 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 
307 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.18 
 
 
302 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2349  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
292 aa  205  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.204462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2115  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.04 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5391  cyclic nucleotide-binding protein  43.57 
 
 
295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
296 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.126315  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
296 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
298 aa  191  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 
295 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
293 aa  188  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0140981  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.08 
 
 
296 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.14 
 
 
297 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5386  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.5 
 
 
297 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567394  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.09 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174281  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  36.14 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1289  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.931423  normal  0.254335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.63 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1771  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  40.48 
 
 
321 aa  182  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0951305  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.18 
 
 
328 aa  182  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.302812  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1770  putative dyhydroflavanol-4-reductase  39.31 
 
 
303 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0116942  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4327  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
295 aa  172  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581681  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00640  hypothetical protein  34.14 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.741497  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
294 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  30.41 
 
 
316 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1160  hypothetical protein  33.12 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.486505  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5032  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
286 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9208  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.34 
 
 
310 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2949  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.262327  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
298 aa  89  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
299 aa  89  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6076  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2030  hypothetical protein  31.54 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
297 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0678139  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247898  normal  0.37073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417998  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0720  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142484  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.584943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0373  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4914  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.61 
 
 
317 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0435  epimerase/dehydratase family protein, putative  28.94 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0291791  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0378  putative epimerase/dehydratase family protein  28.94 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  26.01 
 
 
619 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.2 
 
 
334 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0625265  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  35.04 
 
 
203 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.77 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0889  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.61 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126969 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.22 
 
 
319 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  23.71 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  27.41 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.271886  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2119  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.06 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.54 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
309 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1506  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  44.93 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>