More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0872 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  90.4 
 
 		 246 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  77.92 
 
 		 241 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.26 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.24 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  49.78 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.97 
 
 		 235 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 234 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.6 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  39.66 
 
 		 296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 242 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  40.42 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  41.78 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 228 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 237 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  38.67 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  38.39 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.73 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  35.81 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  34.58 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  34.76 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  35.09 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  35.09 
 
 		 237 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 198 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 253 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  32.23 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  35.11 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  31.56 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.84 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  30.94 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  31.39 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.8 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  25.66 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  32.04 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.39 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>