More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3532 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
446 aa  931    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  66.43 
 
 
433 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  36.8 
 
 
439 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  38.44 
 
 
440 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  36.29 
 
 
440 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.38 
 
 
430 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  32.55 
 
 
406 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  34.76 
 
 
417 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  34.38 
 
 
452 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.9 
 
 
443 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.9 
 
 
443 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  33.58 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  33.75 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  33 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.84 
 
 
448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.98 
 
 
445 aa  199  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.5 
 
 
443 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  33.9 
 
 
440 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  31.73 
 
 
484 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  34.7 
 
 
438 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  32.43 
 
 
422 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  33.91 
 
 
452 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.63 
 
 
417 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  31.93 
 
 
438 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  31.77 
 
 
412 aa  176  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.47 
 
 
434 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  31.01 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  36.33 
 
 
470 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  31.49 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.65 
 
 
519 aa  139  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  36.11 
 
 
454 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  27.29 
 
 
398 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.68 
 
 
408 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28 
 
 
410 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.68 
 
 
408 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.75 
 
 
449 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  26.16 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.84 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.16 
 
 
358 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.76 
 
 
327 aa  103  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  35.1 
 
 
334 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.89 
 
 
345 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  28.22 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  33.14 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.04 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  33.72 
 
 
492 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  32.1 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  36.42 
 
 
350 aa  90.9  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1575  Rieske (2Fe-2S) protein  32.45 
 
 
346 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.869006  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1541  vanillate monooxygenase  33.73 
 
 
423 aa  89.7  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00031597  hitchhiker  0.00167065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.34 
 
 
338 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  32.39 
 
 
349 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.56 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.64 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  31.67 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.81 
 
 
345 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  33.52 
 
 
353 aa  87  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  30.95 
 
 
350 aa  86.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  30.52 
 
 
350 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1818  putative Rieske iron-sulfur protein  37.1 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0390  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.1 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2121  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  32.42 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  31.49 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0488  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  37.1 
 
 
330 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.386184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2244  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2105  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  30.46 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2050  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  35 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0622  putative Rieske (2Fe-2S) protein  36.36 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0948094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  31.02 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.29 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.169671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2122  putative iron-sulphur protein  36.29 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  25.2 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  27.5 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.94 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.14 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  31.4 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  33.53 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1487  Rieske (2Fe-2S) protein  28.74 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.03 
 
 
315 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1067  vanillate monooxygenase  31.58 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  30.51 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
372 aa  82.4  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  28.82 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  23.8 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.22 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.91 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
363 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  34.08 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.99 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0418  Rieske (2Fe-2S) protein  30.22 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.842278  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3266  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.78 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  32.32 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  25.71 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.03 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  28.57 
 
 
358 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>