More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0233 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0233  ribitol 2-dehydrogenase  100 
 
 
242 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.17 
 
 
242 aa  407  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0884  ribitol 2-dehydrogenase (RDH)  74.38 
 
 
242 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.332992  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.9 
 
 
242 aa  363  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1991  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.18 
 
 
242 aa  358  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.29 
 
 
241 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.62 
 
 
241 aa  348  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324633  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3589  hypothetical protein  63.22 
 
 
242 aa  328  4e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00166037  normal  0.283325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.07 
 
 
243 aa  321  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.300132  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.44 
 
 
242 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 
242 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0243  ribitol dehydrogenase  59.09 
 
 
242 aa  297  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0268  ribitol dehydrogenase  58.68 
 
 
242 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.02 
 
 
242 aa  294  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  53.31 
 
 
242 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.31 
 
 
242 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  53.31 
 
 
242 aa  277  9e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.48 
 
 
242 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  48.12 
 
 
241 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.236721  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
254 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
255 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
280 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.81 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
280 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
239 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
239 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  30.8 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
254 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
246 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
250 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.23 
 
 
248 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 
246 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
285 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
248 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
266 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
255 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  28.69 
 
 
239 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
280 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
243 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
248 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
293 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
259 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
246 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04760  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  31.47 
 
 
255 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.87 
 
 
248 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
286 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.7 
 
 
247 aa  102  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
292 aa  101  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
247 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
297 aa  101  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
239 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
239 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  32.74 
 
 
261 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
246 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.76 
 
 
243 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
244 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
281 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
254 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
244 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.25 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 
274 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
244 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
249 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 
246 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.59 
 
 
246 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  34 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
272 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  33.33 
 
 
297 aa  99.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.45 
 
 
238 aa  99  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 
249 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32 
 
 
251 aa  98.6  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  31.45 
 
 
258 aa  99  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.44 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19521  normal  0.023029 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.04 
 
 
264 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
238 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
244 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.11 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>