More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0292 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324633  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.78 
 
 
241 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1991  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.13 
 
 
242 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3589  hypothetical protein  71.43 
 
 
242 aa  353  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00166037  normal  0.283325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0233  ribitol 2-dehydrogenase  68.62 
 
 
242 aa  348  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0884  ribitol 2-dehydrogenase (RDH)  66.95 
 
 
242 aa  341  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.332992  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.27 
 
 
242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.71 
 
 
242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.9 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.300132  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.67 
 
 
242 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.58 
 
 
242 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.9 
 
 
242 aa  293  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0243  ribitol dehydrogenase  57.32 
 
 
242 aa  294  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0268  ribitol dehydrogenase  56.9 
 
 
242 aa  292  4e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3704  ribitol 2-dehydrogenase  54.13 
 
 
242 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0194179  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7375  ribitol 2-dehydrogenase  53.72 
 
 
242 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144533  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.13 
 
 
242 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432228  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.89 
 
 
242 aa  272  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  50.62 
 
 
241 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.92 
 
 
242 aa  235  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.236721  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
231 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
231 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
252 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
241 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  33.89 
 
 
1270 aa  122  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
247 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
246 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.47 
 
 
230 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
242 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
242 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
256 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
254 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.69 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.92 
 
 
246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.1 
 
 
243 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
259 aa  109  5e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
275 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
241 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
281 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  32.14 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 
248 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
257 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
280 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
246 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.65 
 
 
247 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  33.19 
 
 
252 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
259 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.13 
 
 
247 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
262 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
249 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
273 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 
237 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
280 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
245 aa  106  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
254 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.7 
 
 
246 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 
262 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
247 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
254 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
253 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
258 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
249 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
262 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
252 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
244 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
247 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
266 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
244 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
262 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
233 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.28 
 
 
246 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
285 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.14 
 
 
264 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.14 
 
 
264 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  28.46 
 
 
257 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
255 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
239 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
241 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
247 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
257 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
244 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
244 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
244 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>