249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4730 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  100 
 
 
205 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  84.39 
 
 
205 aa  333  9e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  65.53 
 
 
206 aa  261  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  66.67 
 
 
205 aa  261  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  64.56 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  64.56 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  64.56 
 
 
206 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  66.02 
 
 
206 aa  259  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  65.69 
 
 
205 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  64.08 
 
 
206 aa  258  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  65.2 
 
 
205 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  64.71 
 
 
205 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  63.59 
 
 
206 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  65.05 
 
 
206 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  63.59 
 
 
206 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  64.71 
 
 
205 aa  255  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  64.56 
 
 
206 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  64.56 
 
 
206 aa  254  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  64.56 
 
 
206 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  64.56 
 
 
206 aa  254  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  64.56 
 
 
206 aa  254  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  64.56 
 
 
206 aa  254  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  65.05 
 
 
206 aa  254  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  61.27 
 
 
205 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  63.24 
 
 
205 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  61.27 
 
 
205 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  63.59 
 
 
206 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  61.76 
 
 
205 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  60.78 
 
 
204 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  57.77 
 
 
206 aa  245  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  59.31 
 
 
204 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  62.75 
 
 
205 aa  242  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  59.31 
 
 
205 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  59.31 
 
 
205 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  60.78 
 
 
205 aa  221  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  60.29 
 
 
205 aa  204  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  49.25 
 
 
220 aa  191  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  48.51 
 
 
218 aa  187  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  48.79 
 
 
208 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  49.52 
 
 
208 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  53.73 
 
 
221 aa  184  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  47.76 
 
 
215 aa  178  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  46.77 
 
 
214 aa  177  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  45.54 
 
 
221 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  47 
 
 
217 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  49.25 
 
 
518 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  44.06 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  47.98 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  47.8 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  46.31 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  47.45 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  46.91 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  45.77 
 
 
218 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  46.27 
 
 
239 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  46.94 
 
 
214 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  46.27 
 
 
218 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  46.27 
 
 
218 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  48.51 
 
 
224 aa  168  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  50.75 
 
 
206 aa  167  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  43.22 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  46.46 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  45 
 
 
219 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  45.88 
 
 
215 aa  164  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  47.29 
 
 
218 aa  164  9e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  45.81 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  47.52 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  46.53 
 
 
215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  47.98 
 
 
214 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.666008 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  44.12 
 
 
216 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  45.05 
 
 
219 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  46.53 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  46.53 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  46.53 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  46.53 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  46.53 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  45.5 
 
 
218 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3838  hemolysin III family protein  48.02 
 
 
233 aa  158  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.69609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0873  hemolysin III family channel protein  48.02 
 
 
233 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0870  hemolysin III family protein  48.02 
 
 
233 aa  158  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  43 
 
 
215 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  44.83 
 
 
215 aa  158  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  42.36 
 
 
216 aa  157  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 
214 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  51 
 
 
227 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0909  hemolysin III-like protein  44.06 
 
 
221 aa  156  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>