More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0517 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5125  transcriptional regulator, LysR family  72.61 
 
 		 304 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 302 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0279  transcriptional regulator, LysR family  42.24 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0279  transcriptional regulator, LysR family  42.24 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  41.31 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3236  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0163272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  40.26 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4138  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  39.07 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1852  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275595 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5252  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 295 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3530  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3940  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 296 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4923  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.67 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  37.12 
 
 		 305 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 298 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  35.33 
 
 		 299 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 302 aa  195  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 295 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2116  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0265238 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 305 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4311  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  34.31 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0801  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  35.28 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.88 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0797  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.433602  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 298 aa  188  8e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.57 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3568  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.318176  normal  0.117537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 555 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0260  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4510  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172827  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 299 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>