51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2337 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  100 
 
 		 201 aa  406  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  83.25 
 
 		 201 aa  333  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  54 
 
 		 196 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  45 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  44.85 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  43.88 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  43.88 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  46.43 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  37.63 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  38.14 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  37.63 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  40.93 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  36.32 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  39.42 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  37.88 
 
 		 201 aa  87.8  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  37.37 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  37.06 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  32.97 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  32.4 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  30.09 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  31.02 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  39.81 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  31.44 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  30.89 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0847  2'-5' RNA ligase  29.27 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0724174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2842  2',5' RNA ligase  31.82 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0512  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  27.43 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  27.96 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  30.81 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2125  2',5' RNA ligase  27.66 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0687  2'-5' RNA ligase  27.96 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00185494  normal  0.60336 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  29.8 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.62 
 
 		 183 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  25.18 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1635  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 170 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.44124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  29.25 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>