More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1544 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 406 aa  835    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  85.9 
 
 		 377 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  73.81 
 
 		 387 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  77.96 
 
 		 344 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  74.38 
 
 		 348 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  75.96 
 
 		 348 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  75.16 
 
 		 353 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  71.14 
 
 		 353 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  75.72 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  75.72 
 
 		 387 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  75.72 
 
 		 353 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  73.46 
 
 		 877 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  73.89 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  73.89 
 
 		 352 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  75.9 
 
 		 355 aa  485  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  73.46 
 
 		 342 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  73.46 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  73.46 
 
 		 404 aa  484  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  73.46 
 
 		 441 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  73.46 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  72.03 
 
 		 429 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  69.45 
 
 		 333 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  69.58 
 
 		 339 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  68.49 
 
 		 333 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  66.56 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  65.91 
 
 		 332 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  66.34 
 
 		 341 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  65.91 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  65.58 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  65.26 
 
 		 332 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  62.94 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  63.23 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  63.75 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  63.43 
 
 		 332 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  61.37 
 
 		 331 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  57.1 
 
 		 344 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  56.01 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  50.31 
 
 		 331 aa  335  9e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  50.16 
 
 		 333 aa  335  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  57.28 
 
 		 344 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  53.16 
 
 		 381 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  52.46 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  50.33 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  53.64 
 
 		 368 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  45.03 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  43.63 
 
 		 345 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  42.52 
 
 		 330 aa  246  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 		 336 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  39.04 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 		 340 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 343 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 262 aa  86.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 284 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.3 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.84 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  27.72 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  36.61 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  42 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 314 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  41.12 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.9 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  27.41 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 290 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 280 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  29.11 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 345 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  29.11 
 
 		 290 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.73 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  28.48 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 278 aa  72  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3040  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  26.67 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>