More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1220 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 168 aa  339  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  52.69 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.53 
 
 		 296 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  44.12 
 
 		 261 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  44.12 
 
 		 261 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  41.9 
 
 		 261 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  38.52 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.28 
 
 		 226 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 263 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.46 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 510 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 263 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 263 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 262 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 188 aa  84.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  36.29 
 
 		 220 aa  84.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  43.27 
 
 		 318 aa  84.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  45.19 
 
 		 320 aa  84.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 221 aa  84  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  38.36 
 
 		 403 aa  84  9e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  42.16 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  41.59 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  37.9 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  36.36 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  38.69 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 537 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  52.33 
 
 		 223 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.15 
 
 		 607 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  41.18 
 
 		 669 aa  80.9  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  34.68 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  34.68 
 
 		 243 aa  80.5  0.000000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  38.84 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  38.84 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  38.84 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.33 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  38.33 
 
 		 694 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0306  OmpA family protein  40.4 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000558154  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0482  OmpA/MotB domain protein  40.4 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000816193  hitchhiker  0.00000930185 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  42.24 
 
 		 511 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  35.61 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  45.28 
 
 		 452 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 238 aa  77.8  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 230 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  35.48 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  40.4 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  44 
 
 		 407 aa  77.4  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 229 aa  77.4  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 525 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  42.16 
 
 		 641 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 729 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.9 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  43.43 
 
 		 653 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>