More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0306 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0482  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000816193  hitchhiker  0.00000930185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0306  OmpA family protein  100 
 
 		 217 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000558154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2685  OmpA family protein  57.94 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2309  OmpA/MotB domain protein  57.94 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.91 
 
 		 330 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  44.33 
 
 		 334 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  40.85 
 
 		 445 aa  85.9  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  41.96 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.95 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  37.38 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  42.57 
 
 		 326 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.57 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  40.18 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  31.8 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 		 671 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  39.22 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40.95 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.14 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  34.55 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  48.81 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.19 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  47.62 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  47.62 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  35.46 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  39.05 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  46.59 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  37.04 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  33.64 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 623 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  37.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  37.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  37.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  37.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  37.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  35.71 
 
 		 631 aa  76.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  37.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.08 
 
 		 656 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  37.86 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  32.41 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  39.09 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  35.59 
 
 		 523 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.62 
 
 		 407 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 360 aa  75.1  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  31.82 
 
 		 367 aa  75.1  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  37.86 
 
 		 261 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  40.18 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  35.24 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  36.8 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  43.53 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  32.23 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.78 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.62 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  47.76 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33.61 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  38.24 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  36.52 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>