More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0704 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  100 
 
 		 193 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  92.06 
 
 		 189 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  78.72 
 
 		 189 aa  310  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  73.58 
 
 		 192 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  72.54 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  74.58 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  75 
 
 		 193 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  75 
 
 		 193 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  75 
 
 		 193 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  71.5 
 
 		 193 aa  276  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  74.43 
 
 		 195 aa  274  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  74.43 
 
 		 193 aa  273  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  72.73 
 
 		 211 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  69.43 
 
 		 192 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  74.4 
 
 		 187 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  69.43 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  69.43 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  69.43 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  69.43 
 
 		 192 aa  264  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  72.67 
 
 		 187 aa  263  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  72.09 
 
 		 187 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  72.09 
 
 		 187 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  69.05 
 
 		 198 aa  252  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  67.86 
 
 		 198 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  66.07 
 
 		 198 aa  244  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  65.09 
 
 		 196 aa  241  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  64.16 
 
 		 196 aa  237  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  47.67 
 
 		 189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  47.62 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  45.83 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  45.24 
 
 		 191 aa  160  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  49.66 
 
 		 151 aa  155  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  41.21 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  44.05 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  49.31 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  40.59 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  41.24 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  41.28 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  37.13 
 
 		 211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  37.35 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  35.38 
 
 		 192 aa  131  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  40.11 
 
 		 188 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  43.35 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  36.31 
 
 		 218 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  34.24 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  34.24 
 
 		 191 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  34.24 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  40.54 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  34.88 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  39.36 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  34.71 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  40.82 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  35.75 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  40.82 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.33 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.51 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  39.04 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  37.2 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  37.16 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  34.64 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  35.84 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  35.84 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  36.16 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  36.88 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.76 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.22 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  35.68 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  35.88 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  33.93 
 
 		 212 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  36.84 
 
 		 201 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  37.24 
 
 		 182 aa  98.6  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  38.93 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  34.64 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  34.68 
 
 		 200 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  34.66 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  37.29 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  40.13 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  34.52 
 
 		 195 aa  95.9  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  34.87 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  37.27 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  36.67 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  36.26 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  36.67 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  33.16 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  36.67 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  34.29 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.88 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  35.42 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  41.27 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  36 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  40.67 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  39.6 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  33.52 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  35.95 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  33.52 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40.67 
 
 		 223 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  34.17 
 
 		 192 aa  91.3  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  28.87 
 
 		 204 aa  90.9  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>