More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5903 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5903  ABC transporter related  100 
 
 		 351 aa  716    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5256  ABC transporter related  81.53 
 
 		 352 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.336251 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1362  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  82.1 
 
 		 352 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.073818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3375  ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 		 331 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.734729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2894  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  59 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  55.36 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3942  ABC transporter related  58.6 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3268  ABC transporter related  54.99 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3338  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  57.4 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7132  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  57.4 
 
 		 357 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  55.49 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4064  ABC transporter related  57.14 
 
 		 325 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.484241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4738  ABC transporter related  58.77 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0209  ABC transporter-related protein  57.66 
 
 		 333 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0100  ABC transporter related  57.77 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1727  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3637  hypothetical protein  56.8 
 
 		 325 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6279  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (spermidine/putrescine)  51.42 
 
 		 374 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2920  ABC transporter related  52.51 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.905219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2659  ABC transporter related  54.29 
 
 		 363 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1908  ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 368 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.58 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7092  ABC transporter related  55.2 
 
 		 387 aa  272  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106736  normal  0.0652962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 		 423 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  48.12 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4279  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.33 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.714289  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.6 
 
 		 377 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.34 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.34 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.1 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  47.27 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  44.19 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  44.19 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  44.19 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 337 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.88 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.77 
 
 		 365 aa  259  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.82 
 
 		 447 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.96 
 
 		 374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.71 
 
 		 384 aa  258  8e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0149  ABC transporter-like protein  44.05 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.661807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  50.92 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.17 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.15 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.69 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2416  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.48 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.77 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  57.74 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.5 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.31 
 
 		 343 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.59 
 
 		 358 aa  255  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.6 
 
 		 346 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 		 364 aa  255  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.5 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  47.65 
 
 		 331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.88 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  51.61 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  50.38 
 
 		 328 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 		 369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  51.61 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.34 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.78 
 
 		 377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.01 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.87 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  51.61 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 		 327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.46 
 
 		 372 aa  253  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 		 372 aa  252  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42 
 
 		 373 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.82 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.48 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  46.13 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.06 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  44.66 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.26 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.5 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  53.06 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 		 380 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  44.93 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  45.45 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  41.87 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  44.37 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.24 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3217  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.81 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0511175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  48.1 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  46.1 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>