More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5446 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5446  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 327 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.0261809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1224  2-dehydropantoate 2-reductase  73.85 
 
 		 327 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318793 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5382  2-dehydropantoate 2-reductase  73.23 
 
 		 327 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324063  normal  0.227406 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0135  2-dehydropantoate 2-reductase  63.58 
 
 		 324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.878184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0197  2-dehydropantoate 2-reductase  64.81 
 
 		 324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1796  2-dehydropantoate 2-reductase  60.18 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0234  2-dehydropantoate 2-reductase  62.88 
 
 		 325 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0260  2-dehydropantoate 2-reductase  59.94 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1605  2-dehydropantoate 2-reductase  60 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1681  2-dehydropantoate 2-reductase  60.31 
 
 		 326 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2270  2-dehydropantoate 2-reductase  59.08 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191181  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  58.33 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  58.33 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  56.31 
 
 		 331 aa  361  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  55.56 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0153  2-dehydropantoate 2-reductase  54.95 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1345  2-dehydropantoate 2-reductase  47.53 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162184  normal  0.0787128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5228  2-dehydropantoate 2-reductase  46.3 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6152  2-dehydropantoate 2-reductase  46.3 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1927  2-dehydropantoate 2-reductase  46.3 
 
 		 332 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.193569  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1950  2-dehydropantoate 2-reductase  45.68 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0818482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3341  2-dehydropantoate 2-reductase  48.62 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2487  2-dehydropantoate 2-reductase  48.15 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1845  2-dehydropantoate 2-reductase  45.99 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.995272  normal  0.0110748 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1238  2-dehydropantoate 2-reductase  48.31 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1964  2-dehydropantoate 2-reductase  48.31 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.734659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1471  2-dehydropantoate 2-reductase  48.31 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  45.59 
 
 		 332 aa  282  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1915  2-dehydropantoate 2-reductase  46.3 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  45.94 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  44.14 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  44.14 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  44.72 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2371  2-dehydropantoate 2-reductase  46.95 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  44.14 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2330  2-dehydropantoate 2-reductase  46.39 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.787912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2115  2-dehydropantoate 2-reductase  46.91 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  45.57 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  44.62 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  42.2 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  42.81 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3040  2-dehydropantoate 2-reductase  44.89 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  42.19 
 
 		 325 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  43.17 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  43.3 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  41.18 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  43.48 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  42.59 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  41.61 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2462  2-dehydropantoate 2-reductase  41.1 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2793  2-dehydropantoate 2-reductase  41.56 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  41.3 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  40.99 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  40.99 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  38.36 
 
 		 339 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00418767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1558  2-dehydropantoate 2-reductase  46.8 
 
 		 447 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1818  2-dehydropantoate 2-reductase  36.22 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3657  ketopantoate reductase ApbA/PanE  55.14 
 
 		 223 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4110  2-dehydropantoate 2-reductase  35.23 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal  0.957383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1471  2-dehydropantoate 2-reductase  39.63 
 
 		 334 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45590  hypothetical protein  37.14 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3888  2-dehydropantoate 2-reductase  34.27 
 
 		 324 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0769062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  32.32 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  29.47 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  32.52 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  31.61 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  30.58 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  29.65 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.97 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03720  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  29.91 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  31 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  29.61 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 		 295 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  29.6 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2699  2-dehydropantoate 2-reductase  31.91 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  29.15 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  27.58 
 
 		 312 aa  99.4  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  28.86 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  29.5 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  28.88 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  31.37 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.04 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  29.56 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  28.84 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 		 301 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 		 316 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>