More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4191 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4191  4-hydroxyphenylacetate transporter  100 
 
 		 454 aa  912    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04224  hypothetical 4-hydroxyphenylacetate permease  60.14 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04190  hypothetical protein  60.14 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4578  4-hydroxyphenylacetate permease  60.14 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3708  4-hydroxyphenylacetate transporter  60.14 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.517033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1171  4-hydroxyphenylacetate permease  58.42 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1202  4-hydroxyphenylacetate permease  58.42 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1182  4-hydroxyphenylacetate permease  58.21 
 
 		 458 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1217  4-hydroxyphenylacetate permease  58.42 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1066  4-hydroxyphenylacetate permease  58.42 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1641  4-hydroxyphenylacetate permease  58.06 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2454  4-hydroxyphenylacetate transporter  58.06 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.564928  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0632  4-hydroxyphenylacetate transporter  60.55 
 
 		 456 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.862477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2358  4-hydroxyphenylacetate permease  58.06 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.876442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  42.26 
 
 		 432 aa  339  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  39.29 
 
 		 432 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 439 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03502  MFS transporter  40.28 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  41.85 
 
 		 445 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  39.77 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  41.27 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2119  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0773675 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3176  major facilitator family transporter  39.3 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  39.25 
 
 		 432 aa  314  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2540  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.91 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  38.6 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  41.47 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6044  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844487 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 440 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 443 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 440 aa  309  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 441 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2674  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 442 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0200  major facilitator family transporter  42.86 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  40.13 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2692  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  36.93 
 
 		 433 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 454 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 433 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  36.7 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3987  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4100  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.739212  normal  0.289292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1636  MFS transporter  42.62 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0172  major facilitator family transporter  42.62 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 441 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 441 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1906  major facilitator family transporter  38.85 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0516487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 440 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0261  major facilitator superfamily permease  42.39 
 
 		 441 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5472  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 440 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5390  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 440 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3501  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 441 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2910  general substrate transporter  38.46 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 439 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 440 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  40.24 
 
 		 440 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 469 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 440 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  40.24 
 
 		 440 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5623  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 440 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 442 aa  299  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 424 aa  299  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6035  major facilitator transporter  39.4 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.0439191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4880  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 462 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4141  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>