More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0110 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4331  amidase  75.2 
 
 		 522 aa  728    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0390  Amidase  75.69 
 
 		 506 aa  727    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0110  amidase  100 
 
 		 504 aa  1023    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3161  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.03 
 
 		 496 aa  624  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.386322  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1704  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.61 
 
 		 494 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0202  amidase  65.61 
 
 		 492 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.226133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3916  amidase family protein  65.54 
 
 		 517 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3414  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.61 
 
 		 494 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0054  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.74 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3137  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.61 
 
 		 494 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2839  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  65.67 
 
 		 496 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3835  amidase family protein  65.54 
 
 		 521 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254252  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0189  amidase  65.21 
 
 		 492 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3378  amidase  64.81 
 
 		 492 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2832  amidase  65.41 
 
 		 492 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0257  amidase  65.61 
 
 		 492 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0275  amidase  65.41 
 
 		 492 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0183  amidase  64.68 
 
 		 492 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.813319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3197  amidase  41.53 
 
 		 488 aa  325  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3918  Amidase  42.64 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2905  amidase  42.54 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132105  normal  0.0619006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2598  amidase  42.83 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468193  normal  0.210998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3322  Amidase  42.38 
 
 		 476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0501  amidase  40.16 
 
 		 503 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2551  amidase  42.15 
 
 		 474 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0761469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5672  amidase  42.13 
 
 		 489 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0555  amidase  42.58 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0872819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5382  amidase  41.93 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5293  amidase  41.93 
 
 		 489 aa  300  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3515  Amidase  44.84 
 
 		 500 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3583  Amidase  44.25 
 
 		 495 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  39.92 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0088  Amidase  43.39 
 
 		 502 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6405  amidase  40.59 
 
 		 491 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6117  amidase  40.59 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03450  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  40.74 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.524183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4892  amidase  40.75 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3272  amidase  40.75 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4481  Amidase  40.52 
 
 		 494 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6915  amidase  40.75 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128062  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2998  Amidase  43.84 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0561708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1016  amidase  41.58 
 
 		 489 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3433  amidase  43.45 
 
 		 495 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0529991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5822  amidase  41.76 
 
 		 490 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  37.72 
 
 		 531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4526  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase, putative  39.17 
 
 		 481 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5288  glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  38.81 
 
 		 473 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6135  putative amidase  38.48 
 
 		 499 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  39.26 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6315  amidase  39.17 
 
 		 482 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1781  Amidase  41.39 
 
 		 493 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0646123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3043  amidase  40.08 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.020866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4169  amidase  42.13 
 
 		 479 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.291168  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3042  amidase  38.24 
 
 		 476 aa  270  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3602  amidase  41.63 
 
 		 501 aa  269  7e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00171301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2126  Amidase  41.88 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1371  Amidase  39.22 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0228  Amidase  38.67 
 
 		 508 aa  263  6.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2154  amidase  40.88 
 
 		 503 aa  263  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.241394  normal  0.0235675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4268  amidase  39.04 
 
 		 483 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4559  Amidase  43.79 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3242  amidase  39.64 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0927  amidase  39.76 
 
 		 472 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1820  amidase  38.97 
 
 		 483 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1476  6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  40.63 
 
 		 492 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2933  amidase  39.57 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0622  amidase  37.5 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.240573  normal  0.237007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1064  amidase  38.67 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.541776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.65 
 
 		 473 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0431  amidase  36.38 
 
 		 497 aa  236  6e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4710  amidase  38.7 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2705  amidase  41.45 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0919281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3358  amidase  37.9 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.727404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2749  amidase  41.45 
 
 		 489 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2735  amidase  41.45 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395131  normal  0.14189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2401  putative 6-aminohexanoate-cyclic-dimer hydrolase  37.89 
 
 		 485 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0726676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2213  amidase  37.22 
 
 		 468 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0370665  normal  0.373518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4842  amidase  36.08 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00703489  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2910  hypothetical protein  33.19 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1995  amidase  36.18 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2041  amidase  36.18 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2764  hypothetical protein  32.77 
 
 		 460 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1976  amidase  36.18 
 
 		 470 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268082  normal  0.916059 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6284  Amidase  35.02 
 
 		 476 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.319568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4525  amidase  34.84 
 
 		 467 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0692  Amidase  32.79 
 
 		 472 aa  213  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1611  amidase  33.67 
 
 		 486 aa  209  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.581508  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6344  Amidase  34.46 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.918159  normal  0.55014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2108  amidase  34.15 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0334  amidase  33.53 
 
 		 465 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4130  amidase  37.1 
 
 		 468 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0304259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1550  amidase  35.77 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0166  amidase  33.27 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1543  Amidase  36.71 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00658018  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0311  amidase  33.27 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1372  Amidase  34.81 
 
 		 467 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1403  Amidase  34.28 
 
 		 467 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12902  amidase  34.88 
 
 		 473 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.828525  normal  0.749825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  32.15 
 
 		 472 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5815  Amidase  36.09 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.932467  decreased coverage  0.00501532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>