116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5234 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  81.94 
 
 
155 aa  269  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  81.94 
 
 
155 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  83.23 
 
 
155 aa  266  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  78.71 
 
 
155 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  78.71 
 
 
155 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  78.71 
 
 
155 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  70.32 
 
 
160 aa  221  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  70.32 
 
 
160 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  69.68 
 
 
160 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  68 
 
 
154 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  69.39 
 
 
153 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  69.39 
 
 
153 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  68.71 
 
 
153 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  48.95 
 
 
170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  53.79 
 
 
161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.25 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  48.25 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.25 
 
 
161 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  48.25 
 
 
161 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  46.67 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  36.55 
 
 
170 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  40.71 
 
 
190 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  35.66 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.56 
 
 
159 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  37.59 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.56 
 
 
159 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  41.18 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.32 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  40.2 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.81 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  32.62 
 
 
332 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  40.21 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  32.62 
 
 
333 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  41.75 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  36.79 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  38.46 
 
 
160 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  36.54 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  35.85 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.09 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  33.33 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 
160 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  33.33 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  34.95 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.09 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  34.65 
 
 
161 aa  62  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  34.82 
 
 
159 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  34.31 
 
 
129 aa  61.6  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  32.69 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.37 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  34.29 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  33.96 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0904  hypothetical protein  33.87 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  31.68 
 
 
167 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3425  cupin 2, barrel  33.06 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4943  cupin 2 domain-containing protein  33.06 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637992  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5343  cupin 2 domain-containing protein  33.06 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499051  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4561  cupin 2 domain-containing protein  37.61 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  38.14 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  31.37 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  34.43 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.05 
 
 
167 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  32.67 
 
 
167 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 
172 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.09 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  34.31 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  32.74 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  35 
 
 
172 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 
158 aa  51.6  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 
154 aa  50.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  31.48 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1575  DNA-binding protein  34.62 
 
 
249 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 
115 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  46.55 
 
 
114 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0698  DNA-binding protein  33.65 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2423  DNA-binding protein  33.65 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  36.23 
 
 
113 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0768  DNA-binding protein  40.85 
 
 
242 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1221  DNA-binding protein  33.65 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0563936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1146  DNA-binding protein  33.65 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112687  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1732  DNA-binding protein  33.65 
 
 
247 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3025  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 
281 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.925102 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  38.57 
 
 
115 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  39.44 
 
 
122 aa  45.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6377  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
286 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2941  XRE family transcriptional regulator  40.51 
 
 
271 aa  44.3  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0631546  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 
114 aa  44.3  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3075  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 
269 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
372 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
259 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>