More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2949 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  299  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  76.67 
 
 		 150 aa  230  5e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  57.78 
 
 		 150 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  62.41 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  58.09 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  42.34 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 157 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  45.95 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.82 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 151 aa  67  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  37.12 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  35.51 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38.81 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  37.07 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  34.56 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 152 aa  50.8  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 151 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.64 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>