More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1553 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 253 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  72.11 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  57.71 
 
 		 256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  59.41 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  58.4 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  56.72 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  57.14 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  56.72 
 
 		 253 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  55.46 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  41.81 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  40.85 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  36.96 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  38.63 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  38.17 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  38.08 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  37.77 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  38.5 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  35.37 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  38.4 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  36.48 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  36.48 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  35.59 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  38.05 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.29 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  39.41 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  34.91 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  34.44 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  36.88 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  36.68 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  39.75 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  35 
 
 		 298 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  36.44 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  35 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  36.71 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  35.29 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  37.04 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  37.24 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  34.71 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  35.09 
 
 		 275 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  38.33 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  32.22 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  32.05 
 
 		 303 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  32.58 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  31.84 
 
 		 338 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 		 304 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  32.66 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  35.98 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 		 362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  35 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  34.3 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  35.53 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  36 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  35.9 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  31.56 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  34.09 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  37.34 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  33.05 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  34.93 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  32.05 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  31.09 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  33.33 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  32.08 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  34.82 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  35.54 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  30.68 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  36.18 
 
 		 247 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  35.02 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  32.08 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  30.34 
 
 		 277 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  29.78 
 
 		 298 aa  131  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  31.8 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  31.8 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  35.62 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  31.12 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  33.61 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 310 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  35.25 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  33.02 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 797 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  34.69 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  38.53 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  32.17 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>