124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5203 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  90.58 
 
 		 223 aa  417  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  89.69 
 
 		 223 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87.89 
 
 		 223 aa  410  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87 
 
 		 223 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87.89 
 
 		 223 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87.89 
 
 		 223 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87.44 
 
 		 223 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  87.89 
 
 		 223 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  86.1 
 
 		 223 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.12 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  46.19 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  45.71 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  45.71 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  45.19 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  45.19 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  45.19 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  45.19 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  44.71 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  34.21 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.89 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.46 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 230 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.89 
 
 		 243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.18 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1761  cyclic nucleotide-binding protein  33.5 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.93 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  28.64 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  29.89 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  26.48 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  26.22 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  26.03 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0522  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.87 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.47 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.47 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1723  cyclic nucleotide-binding  32.1 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.26 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_002950  PG0396  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 352 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  20.94 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3749  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.9168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  19.9 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.65 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  19.7 
 
 		 355 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  28.16 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.31 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  23.76 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.17 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.08 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.65 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  27.72 
 
 		 729 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  19.37 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  19.9 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2638  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.97 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 		 624 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  19.37 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  20.31 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.31 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  24.26 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.85 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  19.8 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  20.31 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  21.93 
 
 		 507 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>