164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3203 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  95.4 
 
 
348 aa  671    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  100 
 
 
348 aa  717    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  89.63 
 
 
348 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  45.35 
 
 
385 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  43.6 
 
 
387 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  44.19 
 
 
385 aa  285  7e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  43.9 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2450  agmatine deiminase  42.15 
 
 
393 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  38.51 
 
 
639 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  37.43 
 
 
640 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  38.42 
 
 
339 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  36.71 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  36.36 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  37.9 
 
 
624 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  36.16 
 
 
350 aa  233  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  35.14 
 
 
349 aa  229  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  36.18 
 
 
349 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  36.93 
 
 
348 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  36.18 
 
 
352 aa  225  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.45 
 
 
347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  36.13 
 
 
342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  34.99 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  35.77 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  35.92 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  32.95 
 
 
343 aa  212  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  34.21 
 
 
334 aa  209  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  33.72 
 
 
353 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  35.67 
 
 
347 aa  209  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  34.4 
 
 
348 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  34.96 
 
 
346 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.78 
 
 
631 aa  205  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  33.24 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  33.62 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  34.68 
 
 
356 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  31.87 
 
 
341 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  30.37 
 
 
358 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  31.12 
 
 
346 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  33.43 
 
 
365 aa  185  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  32.75 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  30.42 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  33.04 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  32.38 
 
 
346 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  31.32 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  29.83 
 
 
334 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  30.88 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  31.23 
 
 
350 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  31.88 
 
 
371 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0059  Agmatine deiminase  31.52 
 
 
375 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  31.98 
 
 
345 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  32.35 
 
 
342 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  31.98 
 
 
345 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  32.94 
 
 
343 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  29.12 
 
 
369 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  30.99 
 
 
357 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  31.59 
 
 
374 aa  176  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  31.69 
 
 
344 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  32.56 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  31.88 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  30 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  30.29 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  30.33 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  28.33 
 
 
370 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  32.06 
 
 
364 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  28.65 
 
 
364 aa  169  6e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  29.23 
 
 
363 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  30.61 
 
 
375 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4626  agmatine deiminase  30.06 
 
 
369 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192221  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  28.94 
 
 
363 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  29.82 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1048  agmatine deiminase  31.71 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.649771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  31.18 
 
 
346 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  29.86 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  29.86 
 
 
343 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  29.62 
 
 
327 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  31.01 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  31.58 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0681  Agmatine deiminase  30.79 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0759  peptidyl-arginine deiminase  30.09 
 
 
336 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.451964  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  31.03 
 
 
332 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  30.99 
 
 
376 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  31.69 
 
 
341 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  34.33 
 
 
372 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  28.96 
 
 
368 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  31.71 
 
 
350 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  30.16 
 
 
368 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  28.1 
 
 
365 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  28.4 
 
 
336 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  30.09 
 
 
341 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2405  agmatine deiminase  28.42 
 
 
365 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.761895  normal  0.0406266 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2812  Agmatine deiminase  29.75 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.872566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  29.49 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  27.67 
 
 
368 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  29.39 
 
 
346 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0833  Agmatine deiminase  29.8 
 
 
339 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  28.42 
 
 
368 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  30.49 
 
 
366 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  29.25 
 
 
375 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  27.62 
 
 
365 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  28.77 
 
 
368 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>