More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2553 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  97.07 
 
 		 239 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  95.82 
 
 		 239 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  86.19 
 
 		 239 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  86.19 
 
 		 239 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  78.44 
 
 		 249 aa  354  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  73.59 
 
 		 241 aa  345  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 		 235 aa  338  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  72.93 
 
 		 235 aa  338  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  70.17 
 
 		 241 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  72.88 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  77.1 
 
 		 241 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  69.75 
 
 		 243 aa  330  9e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  74.27 
 
 		 249 aa  329  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  68.07 
 
 		 243 aa  328  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  68.2 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  73.83 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  66.67 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  71.16 
 
 		 242 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  64.56 
 
 		 245 aa  307  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  69.59 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  64.66 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  50.25 
 
 		 256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  52.86 
 
 		 234 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  53.33 
 
 		 236 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  51.98 
 
 		 236 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  51.56 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  50.99 
 
 		 245 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  49.05 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  48.82 
 
 		 232 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  47.8 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  48.48 
 
 		 239 aa  197  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  45.28 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  45.28 
 
 		 233 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  47.52 
 
 		 237 aa  191  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  46.76 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  43.24 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  45.5 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  47.94 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  56.78 
 
 		 149 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  59.38 
 
 		 114 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  56.12 
 
 		 118 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  43.75 
 
 		 118 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  50.54 
 
 		 126 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  33.61 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  32.39 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0064  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  31.62 
 
 		 285 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.534501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  30.52 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  32.95 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.45 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  31.08 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  30.36 
 
 		 257 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  32.23 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0853  sporulation sigma factor SigG  30.24 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0182418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.56 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  30.83 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0836  sporulation sigma factor SigG  31.93 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.904059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  32.51 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  41.67 
 
 		 113 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  30.83 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3119  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.23 
 
 		 326 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1067  sporulation sigma factor SigG  30.5 
 
 		 257 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000166979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1079  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.88 
 
 		 296 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  32.92 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3432  RNA polymerase sigma-38 factor  29.62 
 
 		 326 aa  93.2  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  29.44 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2749  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.69 
 
 		 326 aa  93.2  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3212  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.3 
 
 		 330 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.487557  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1085  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  29.27 
 
 		 320 aa  93.2  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0522379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0872  RNA polymerase sigma factor RpoS  29.3 
 
 		 330 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1123  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.62 
 
 		 326 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1194  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.62 
 
 		 326 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1124  RNA polymerase, sigma 38 subunit, RpoS  29.62 
 
 		 326 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1213  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.64 
 
 		 324 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2552  sporulation sigma factor SigG  29.89 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000004552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0120  RNA polymerase, sigma 28 subunit  32.59 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03517  hypothetical protein  28.91 
 
 		 328 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  31.28 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002516  RNA polymerase sigma factor RpoS  28.91 
 
 		 328 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3128  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.23 
 
 		 326 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1237  sporulation sigma factor SigG  30.27 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1245  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.23 
 
 		 326 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.411027  unclonable  0.00000000000310525 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3271  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.23 
 
 		 326 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.589431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>