More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4861 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  53.47 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  53.47 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  53.47 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  55.94 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  52.97 
 
 		 204 aa  227  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  56.44 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  52.97 
 
 		 204 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  56.44 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  56.44 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  51.24 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  55.17 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  52.74 
 
 		 207 aa  207  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  54.68 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  56.73 
 
 		 178 aa  198  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  56.36 
 
 		 166 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  55.15 
 
 		 166 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  55.15 
 
 		 166 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  44.95 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  40.3 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  39.63 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  36.28 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  45.41 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  42.86 
 
 		 219 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  34.65 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  32.35 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  36.32 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  51.43 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  30.65 
 
 		 357 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1805  peptide chain release factor 2  35.16 
 
 		 358 aa  95.5  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.361195  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  30.15 
 
 		 362 aa  94  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  31.68 
 
 		 331 aa  91.7  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  29.15 
 
 		 356 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  35.12 
 
 		 378 aa  89.4  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1869  hypothetical protein  32.2 
 
 		 371 aa  88.2  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  31.66 
 
 		 369 aa  88.2  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  32.2 
 
 		 367 aa  87.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  39.1 
 
 		 330 aa  87.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0075  peptide chain release factor 2  31.14 
 
 		 282 aa  87  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00578068  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0804  peptide chain release factor 2  33.53 
 
 		 376 aa  87  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0724  peptide chain release factor 2  30.39 
 
 		 312 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0360  peptide chain release factor 2  32.94 
 
 		 365 aa  85.9  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  31.22 
 
 		 367 aa  85.1  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 369 aa  85.1  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  29.69 
 
 		 366 aa  85.1  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1305  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 376 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0721349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2265  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 321 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0912  peptide chain release factor 2  33.53 
 
 		 375 aa  84.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.779276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  30 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3293  Class I peptide chain release factor  42.94 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.214726  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1302  peptide chain release factor 2  35.12 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.240882  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  32.89 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2907  peptide chain release factor 1  33 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0137  peptide chain release factor 1  47.87 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal  0.125169 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1552  peptide chain release factor 1  33 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00635005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1396  peptide chain release factor 2  32.35 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145542  normal  0.663768 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01240  hypothetical protein  44.33 
 
 		 480 aa  82.8  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2760  peptide chain release factor 1  30.69 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1113  peptide chain release factor 1  32.5 
 
 		 351 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.0276117 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  31.6 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  31.66 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2380  peptide chain release factor 1  30.69 
 
 		 365 aa  82.4  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.254087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  27.18 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  30.73 
 
 		 362 aa  82  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  31.36 
 
 		 323 aa  82  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  31.03 
 
 		 356 aa  82  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  32.18 
 
 		 368 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  31.76 
 
 		 325 aa  81.3  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  29.7 
 
 		 366 aa  81.3  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  32.74 
 
 		 368 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  34.08 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  42.71 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1715  peptide chain release factor 2  33.14 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.833664  normal  0.278616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  31.22 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0169  peptide chain release factor 2  29 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0400859  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0555  Peptide chain release factor 2  32.74 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000388438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  28.71 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2575  peptide chain release factor 2  32.54 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.677402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  34.1 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3599  peptide chain release factor 1  29.7 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1825  peptide chain release factor 2  31.95 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0437  peptide chain release factor 2  34.56 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  33.11 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  32.74 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0922  peptide chain release factor 1  46.81 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.276919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  27.54 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2784  peptide chain release factor 2  30.69 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  30.58 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2040  peptide chain release factor 2  32.35 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  32.75 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  34.27 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4671  peptide chain release factor 2  32.16 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  29.05 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1044  peptide chain release factor 1  32.61 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1645  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  32.97 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  30.54 
 
 		 383 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1330  protein chain release factor B  31.95 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000274876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1733  peptide chain release factor 1  31.84 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>